More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2795 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 530 aa  1091    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  93.31 
 
 		 523 aa  996    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  76.15 
 
 		 776 aa  805    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  44.11 
 
 		 453 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  39.05 
 
 		 474 aa  309  8e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  38.25 
 
 		 471 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  37.84 
 
 		 479 aa  298  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  34.84 
 
 		 463 aa  290  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  37.32 
 
 		 455 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  37.04 
 
 		 481 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  32.78 
 
 		 486 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  30.27 
 
 		 506 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  33.26 
 
 		 727 aa  230  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  32.19 
 
 		 459 aa  229  7e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  32.61 
 
 		 458 aa  225  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 489 aa  224  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  32.27 
 
 		 467 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  26.75 
 
 		 496 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  32.54 
 
 		 471 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  32.68 
 
 		 471 aa  217  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  30.02 
 
 		 512 aa  216  8e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  29.98 
 
 		 609 aa  216  8e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  30.11 
 
 		 441 aa  216  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  28.54 
 
 		 495 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  31.51 
 
 		 441 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  29.98 
 
 		 445 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  32.84 
 
 		 465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  29.24 
 
 		 573 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  29.86 
 
 		 578 aa  213  7.999999999999999e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  30.96 
 
 		 492 aa  212  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  32.38 
 
 		 470 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  31.71 
 
 		 472 aa  210  5e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  30.59 
 
 		 573 aa  210  6e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  30.51 
 
 		 487 aa  209  8e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 447 aa  209  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  32.4 
 
 		 442 aa  206  7e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  30.78 
 
 		 519 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  28.71 
 
 		 569 aa  204  3e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  29.5 
 
 		 579 aa  203  6e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  27.22 
 
 		 561 aa  203  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  27.89 
 
 		 513 aa  200  3.9999999999999996e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  27.24 
 
 		 491 aa  200  6e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  26.07 
 
 		 495 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  28.31 
 
 		 559 aa  197  3e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  28.7 
 
 		 436 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.93 
 
 		 464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  26.17 
 
 		 581 aa  188  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  28.08 
 
 		 533 aa  183  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  30.47 
 
 		 608 aa  176  8e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  29.18 
 
 		 514 aa  174  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  29.18 
 
 		 514 aa  174  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  29.18 
 
 		 514 aa  174  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 		 582 aa  173  5.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  36.98 
 
 		 588 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  36.47 
 
 		 543 aa  166  8e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  25.83 
 
 		 706 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1734  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.38 
 
 		 329 aa  72.8  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0326  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.89 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0709  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.75 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 		 412 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  30.14 
 
 		 394 aa  63.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  28.19 
 
 		 389 aa  63.2  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  24.19 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4668  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.03 
 
 		 326 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.27 
 
 		 341 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8971  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2160  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.84 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  29.36 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.96 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1880  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1320  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.1 
 
 		 327 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  26.38 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  26.38 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  26.38 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  28.31 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  28.19 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  26.73 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5946  molybdopterin biosynthesis, protein A  32.57 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302426  normal  0.0104705 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1230  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.05 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0359079 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  27.19 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  28.3 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  29.3 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  27.5 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.02 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.49 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  28.5 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  26.49 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  27.97 
 
 		 409 aa  57  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  30.06 
 
 		 409 aa  57  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4120  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.14 
 
 		 326 aa  56.6  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4402  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.12 
 
 		 326 aa  56.6  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320325  hitchhiker  0.00467523 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  29.61 
 
 		 332 aa  56.6  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2526  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 		 340 aa  56.2  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.96 
 
 		 337 aa  56.2  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.62159  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  27.97 
 
 		 396 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  22.12 
 
 		 382 aa  55.5  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>