More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1889 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 441 aa  917    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  58.85 
 
 		 436 aa  549  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  34.23 
 
 		 447 aa  273  5.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  34.4 
 
 		 445 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  36.22 
 
 		 441 aa  263  4e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  35.55 
 
 		 727 aa  262  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  35.89 
 
 		 470 aa  259  7e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  32.37 
 
 		 492 aa  256  5e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  33.56 
 
 		 442 aa  254  3e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  31.89 
 
 		 459 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  33.7 
 
 		 458 aa  247  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  31.74 
 
 		 506 aa  246  8e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  40.82 
 
 		 496 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  33.91 
 
 		 465 aa  243  6e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  31.98 
 
 		 467 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  33.71 
 
 		 453 aa  230  5e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  30.4 
 
 		 495 aa  228  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  36.31 
 
 		 561 aa  227  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  32.89 
 
 		 471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  33.26 
 
 		 471 aa  226  9e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  28.78 
 
 		 495 aa  219  5e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.02 
 
 		 464 aa  219  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  31.51 
 
 		 530 aa  216  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  29.14 
 
 		 491 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  32.3 
 
 		 776 aa  212  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  30.75 
 
 		 608 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 513 aa  210  3e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  28.04 
 
 		 512 aa  209  9e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  30.04 
 
 		 523 aa  208  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  27.68 
 
 		 487 aa  204  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 		 569 aa  203  5e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  31.24 
 
 		 472 aa  203  6e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  37.43 
 
 		 543 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 		 573 aa  199  7e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  30.97 
 
 		 455 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  35.26 
 
 		 519 aa  199  9e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 		 489 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  27.31 
 
 		 573 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  30.32 
 
 		 474 aa  196  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 		 579 aa  196  5.000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  27.38 
 
 		 578 aa  195  1e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  33.53 
 
 		 463 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  31.35 
 
 		 609 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  32.9 
 
 		 588 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  26.7 
 
 		 479 aa  172  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  31.5 
 
 		 559 aa  170  5e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  30.97 
 
 		 471 aa  170  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  32.82 
 
 		 581 aa  165  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  27.18 
 
 		 486 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  32.2 
 
 		 582 aa  161  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  29.76 
 
 		 481 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  28.74 
 
 		 533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  27.39 
 
 		 706 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  30.22 
 
 		 514 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 		 514 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 		 514 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0925  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  32.8 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7629  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.48 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  30.63 
 
 		 565 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1762  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.05 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.114768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2703  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.05 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4120  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.9 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.13 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.321552  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  30 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4402  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.06 
 
 		 326 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320325  hitchhiker  0.00467523 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0326  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.52 
 
 		 318 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1655  molybdenum cofactor synthesis-like protein  32.62 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.44 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1230  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.83 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0359079 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.76 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1465  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.64 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  32.05 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3524  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.9 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3175  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.98 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.53 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1959  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.53 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0284  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.9 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1937  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.53 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2133  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.53 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0277  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.9 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.74 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0281  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.9 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2166  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.93 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1976  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.53 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1760  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.39 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7115  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0285  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.9 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4564  molybdenum cofactor synthesis-like  29.33 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0411  Radical SAM domain protein  32.61 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  29.31 
 
 		 496 aa  73.2  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.09 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.32 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.62159  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00947  Molybdopterin cofactor biosynthetic proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13382]  27.88 
 
 		 694 aa  73.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0087  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.32 
 
 		 337 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0823878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2045  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.39 
 
 		 323 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4793  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.9 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113371  hitchhiker  0.00000239799 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4556  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.13 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002954  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.32 
 
 		 329 aa  72  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.761201  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2160  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.91 
 
 		 322 aa  72  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  30.95 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>