More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0115 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 559 aa  1177    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  48.95 
 
 		 609 aa  560  1e-158  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  44.58 
 
 		 581 aa  529  1e-149  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  46.46 
 
 		 582 aa  501  1e-140  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  39.65 
 
 		 495 aa  428  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  39.8 
 
 		 489 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  40.04 
 
 		 506 aa  411  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  39.71 
 
 		 487 aa  409  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  40.44 
 
 		 491 aa  404  1e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  39.55 
 
 		 495 aa  404  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  39.14 
 
 		 512 aa  398  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  40.6 
 
 		 472 aa  396  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  38.93 
 
 		 496 aa  377  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  37.97 
 
 		 561 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  38.39 
 
 		 513 aa  357  2.9999999999999997e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  37.57 
 
 		 578 aa  348  1e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  36.81 
 
 		 573 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  36.88 
 
 		 579 aa  339  7e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  35.01 
 
 		 569 aa  339  8e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  36.83 
 
 		 573 aa  334  3e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  32.87 
 
 		 608 aa  289  8e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  32.79 
 
 		 470 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 		 441 aa  216  8e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  30.23 
 
 		 447 aa  206  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  30.53 
 
 		 445 aa  206  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  30.4 
 
 		 492 aa  200  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  28.31 
 
 		 530 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 		 458 aa  194  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  28.7 
 
 		 727 aa  190  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 		 523 aa  189  8e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  27.7 
 
 		 436 aa  187  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  27.77 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  28.01 
 
 		 442 aa  180  8e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  27.11 
 
 		 776 aa  179  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.72 
 
 		 464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  26.62 
 
 		 706 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  31.5 
 
 		 441 aa  170  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  29.1 
 
 		 543 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  33.96 
 
 		 471 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  31.03 
 
 		 459 aa  163  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 471 aa  161  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  27.2 
 
 		 474 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  26.49 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 		 519 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  31.42 
 
 		 465 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  25.85 
 
 		 486 aa  143  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  26.25 
 
 		 479 aa  140  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  30.56 
 
 		 588 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  24.59 
 
 		 471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  22.46 
 
 		 514 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  22.46 
 
 		 514 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  22.46 
 
 		 514 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  21.04 
 
 		 533 aa  83.6  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.34 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.321552  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0829  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.14 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1976  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.88 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0925  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.64 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.01 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.27 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.623593  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.81 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3175  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.88 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  23.46 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.27 
 
 		 337 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0928  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.9 
 
 		 329 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2133  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.27 
 
 		 337 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1392  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.96 
 
 		 317 aa  62.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.73 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1959  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.27 
 
 		 337 aa  62.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1937  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.27 
 
 		 337 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2612  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.37 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.61 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0378398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0240  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.17 
 
 		 330 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1445  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.54 
 
 		 297 aa  62  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 		 325 aa  62.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0896  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.9 
 
 		 329 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.9 
 
 		 329 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0837  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.9 
 
 		 329 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0865  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.9 
 
 		 329 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0892  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.41 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1023  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.96 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165145 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2861  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.73 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.228383  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3146  molybdenum cofactor biosynthesis protein A, putative  27.17 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2166  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.73 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2571  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.73 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.27 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0835  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.73 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.344402  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00748  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.73 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.73 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0929  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.73 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2862  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.73 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0111085  normal  0.0131262 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.54 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00765  hypothetical protein  25.73 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0844  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.73 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0987442  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0143  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.45 
 
 		 334 aa  59.7  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.391723 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  32.39 
 
 		 398 aa  59.7  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1604  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.09 
 
 		 328 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1477  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  21.17 
 
 		 343 aa  59.7  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>