More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2391 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  100 
 
 		 455 aa  939    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  67.99 
 
 		 474 aa  669    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  57.74 
 
 		 479 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  52.62 
 
 		 486 aa  531  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  51.33 
 
 		 463 aa  510  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  52.32 
 
 		 471 aa  504  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  52.65 
 
 		 481 aa  502  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  39.43 
 
 		 453 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  38.31 
 
 		 776 aa  298  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  37.32 
 
 		 530 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  36.94 
 
 		 523 aa  282  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  34.75 
 
 		 459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  35.56 
 
 		 471 aa  230  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  35.15 
 
 		 471 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  34.68 
 
 		 470 aa  222  9e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  33.93 
 
 		 441 aa  219  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 727 aa  219  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  34.97 
 
 		 442 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  30 
 
 		 561 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  33.7 
 
 		 436 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  35.13 
 
 		 465 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  33.12 
 
 		 467 aa  209  7e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  33.04 
 
 		 458 aa  208  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  29.86 
 
 		 447 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  29.11 
 
 		 495 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.19 
 
 		 464 aa  199  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  30.97 
 
 		 441 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  31.7 
 
 		 533 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  27.65 
 
 		 496 aa  196  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  27.44 
 
 		 495 aa  193  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  29.96 
 
 		 472 aa  192  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  28.45 
 
 		 489 aa  192  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  28.41 
 
 		 445 aa  187  3e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  32.04 
 
 		 514 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  32.04 
 
 		 514 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  32.04 
 
 		 514 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  27.73 
 
 		 506 aa  187  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  28.15 
 
 		 487 aa  186  7e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  26.51 
 
 		 513 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  29.5 
 
 		 608 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  27.77 
 
 		 491 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  30.91 
 
 		 519 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  28.43 
 
 		 573 aa  179  7e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  27.89 
 
 		 578 aa  176  6e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  28.93 
 
 		 609 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  28.43 
 
 		 573 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  35.88 
 
 		 492 aa  172  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 579 aa  172  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  36.12 
 
 		 543 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  27.73 
 
 		 569 aa  167  4e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  26.71 
 
 		 512 aa  167  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 		 582 aa  163  7e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  34.82 
 
 		 588 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 		 581 aa  149  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  26.49 
 
 		 559 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  28.4 
 
 		 706 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1320  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.18 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  32.8 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  31.77 
 
 		 501 aa  72  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.98 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  32.28 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.31 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1512  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.86 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2836  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.39 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3349  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.37 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366452  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1434  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.39 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2952  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.38 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2922  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.39 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.347624  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.7 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3487  Radical SAM domain protein  28.89 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  31.79 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.89 
 
 		 342 aa  66.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.89 
 
 		 342 aa  66.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  31.28 
 
 		 380 aa  66.6  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_004310  BR0958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.7 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.105392  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2435  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.94 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.168492  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0928  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.27 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2571  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.63 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000120862  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00748  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.63 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2861  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.63 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.228383  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.63 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0844  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.63 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0987442  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0929  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.63 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00765  hypothetical protein  28.63 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2862  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.63 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0111085  normal  0.0131262 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0896  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.63 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0835  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.63 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.344402  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02954  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.55 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0865  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.63 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0837  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.63 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.63 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0948  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.25 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  33.55 
 
 		 363 aa  63.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1351  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.23 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0729  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.91 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000041068  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2526  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.56 
 
 		 340 aa  62  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.17 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  36.17 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1302  radical SAM domain-containing protein  40.2 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>