More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0020 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  85.71 
 
 		 582 aa  1060    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 581 aa  1212    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  50.37 
 
 		 609 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  44.58 
 
 		 559 aa  529  1e-149  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  40.47 
 
 		 495 aa  422  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  41.5 
 
 		 506 aa  409  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  40.08 
 
 		 496 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  41.54 
 
 		 489 aa  396  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  40.44 
 
 		 491 aa  398  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  40.67 
 
 		 495 aa  389  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  39.1 
 
 		 512 aa  386  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  40.8 
 
 		 487 aa  383  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  42.71 
 
 		 472 aa  382  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  38.29 
 
 		 579 aa  374  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  39.3 
 
 		 573 aa  374  1e-102  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  38.56 
 
 		 578 aa  371  1e-101  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  39.48 
 
 		 573 aa  368  1e-100  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  36.72 
 
 		 569 aa  360  3e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  35.36 
 
 		 561 aa  346  7e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  36.12 
 
 		 513 aa  332  1e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  34.5 
 
 		 608 aa  300  6e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  30.96 
 
 		 445 aa  221  3e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 		 492 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  28.63 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  29.78 
 
 		 727 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  29.71 
 
 		 459 aa  211  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  29.48 
 
 		 470 aa  209  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 		 442 aa  201  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  29.26 
 
 		 471 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  29.84 
 
 		 458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  27.91 
 
 		 441 aa  196  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  29.39 
 
 		 447 aa  193  6e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.49 
 
 		 464 aa  193  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  28.32 
 
 		 471 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  26.17 
 
 		 530 aa  188  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  28.17 
 
 		 436 aa  183  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 523 aa  181  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 467 aa  179  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  26.89 
 
 		 519 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  28.94 
 
 		 465 aa  178  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  27 
 
 		 706 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  25.49 
 
 		 776 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  32.82 
 
 		 441 aa  165  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 		 481 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  26.41 
 
 		 486 aa  151  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  26.95 
 
 		 479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  26.12 
 
 		 455 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  31.04 
 
 		 543 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  27.62 
 
 		 463 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  27.54 
 
 		 471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  30.29 
 
 		 588 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  26.54 
 
 		 474 aa  137  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  21.84 
 
 		 533 aa  88.6  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  21.39 
 
 		 514 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  21.39 
 
 		 514 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  21.39 
 
 		 514 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  29.55 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1990  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.47 
 
 		 335 aa  67  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.25 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  27.59 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2100  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.93 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.22 
 
 		 308 aa  63.5  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.96 
 
 		 356 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0591  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.43 
 
 		 328 aa  63.2  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1830  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.17 
 
 		 334 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4597  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.45 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4127  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.49 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2030  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.7 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.47 
 
 		 327 aa  62.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1291  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.45 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1230  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.4 
 
 		 361 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0359079 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.32 
 
 		 341 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  32.52 
 
 		 399 aa  62  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1023  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.45 
 
 		 327 aa  62  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165145 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.87 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2266  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.04 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00162832  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3388  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.03 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.46 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.2 
 
 		 353 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.989174  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.29 
 
 		 344 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3906  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.67 
 
 		 334 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  30.94 
 
 		 325 aa  59.7  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  40.79 
 
 		 561 aa  58.9  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7629  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.86 
 
 		 342 aa  59.3  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0240  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.29 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1648  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.13 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.918642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  29.86 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.91 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  25.77 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.09 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00116324  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.13 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.412863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  31.06 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2711  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.52 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.122417 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1785  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2651  Radical SAM domain protein  23.12 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.135076 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.36 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  28.8 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.65 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.93 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.9 
 
 		 327 aa  57  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.491091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>