More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1003 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  67.63 
 
 		 512 aa  733    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  69.4 
 
 		 487 aa  755    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  64.54 
 
 		 495 aa  706    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 489 aa  1025    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  61.52 
 
 		 491 aa  655    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  48.48 
 
 		 506 aa  487  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  46.56 
 
 		 495 aa  482  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  45.33 
 
 		 496 aa  462  1e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  46.98 
 
 		 609 aa  463  1e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  49.67 
 
 		 472 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  42.25 
 
 		 513 aa  422  1e-117  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  41.77 
 
 		 561 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  39.8 
 
 		 559 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  44.99 
 
 		 573 aa  409  1e-113  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  43.68 
 
 		 573 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  44.12 
 
 		 579 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  43.22 
 
 		 578 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  41.54 
 
 		 581 aa  396  1e-109  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  42.18 
 
 		 582 aa  392  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  39.61 
 
 		 569 aa  379  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  40.04 
 
 		 608 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  36.94 
 
 		 458 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  34.96 
 
 		 727 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  34.95 
 
 		 459 aa  271  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  33.81 
 
 		 447 aa  268  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  32.77 
 
 		 441 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  34.03 
 
 		 445 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  32.99 
 
 		 470 aa  259  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 471 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  34.3 
 
 		 471 aa  256  6e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  32.69 
 
 		 492 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  33.6 
 
 		 465 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  32.85 
 
 		 453 aa  244  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  32.99 
 
 		 442 aa  239  9e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  30.04 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.58 
 
 		 464 aa  229  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  30.28 
 
 		 706 aa  227  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 530 aa  224  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  31.36 
 
 		 776 aa  221  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  30.71 
 
 		 523 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  30.06 
 
 		 467 aa  220  5e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  30.53 
 
 		 519 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  30.87 
 
 		 543 aa  203  7e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  29.89 
 
 		 471 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 		 441 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  30.77 
 
 		 479 aa  196  8.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  28.45 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  28.63 
 
 		 474 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  29.32 
 
 		 463 aa  187  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  27.86 
 
 		 481 aa  186  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  35.44 
 
 		 588 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  27.55 
 
 		 486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  24.18 
 
 		 533 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  23.72 
 
 		 514 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  23.72 
 
 		 514 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  23.72 
 
 		 514 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  34 
 
 		 399 aa  91.3  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1976  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.09 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.71 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.96 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.72 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1959  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.72 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1937  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.72 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2133  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.72 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.99 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1759  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.88 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2166  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.72 
 
 		 337 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  32.45 
 
 		 395 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.93 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.76 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.64 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.321552  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  28.2 
 
 		 496 aa  77.8  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0260  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.08 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3175  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.26 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  34.76 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.79 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2160  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.97 
 
 		 322 aa  76.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.73 
 
 		 317 aa  76.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  32.45 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.96 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.33 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.989174  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4556  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.27 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4867  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.44 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5946  molybdopterin biosynthesis, protein A  29.63 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302426  normal  0.0104705 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.57 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  34.41 
 
 		 399 aa  73.2  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2266  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.09 
 
 		 329 aa  72.8  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00162832  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.03 
 
 		 333 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0729  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.43 
 
 		 380 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.10573 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.52 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.986754 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1392  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.21 
 
 		 317 aa  72.4  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  30.1 
 
 		 380 aa  72  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2567  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.01 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  32.98 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  30.1 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.81 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  31.55 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  30.59 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>