More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1009 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  88.85 
 
 		 578 aa  1088    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  87.79 
 
 		 579 aa  1053    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  93.37 
 
 		 573 aa  1138    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  66.84 
 
 		 569 aa  837    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 573 aa  1191    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  46.36 
 
 		 491 aa  425  1e-117  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  42.94 
 
 		 506 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  44.99 
 
 		 489 aa  409  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  42.09 
 
 		 495 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 		 496 aa  402  1e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  42.51 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  42.97 
 
 		 487 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  40.3 
 
 		 609 aa  398  1e-109  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  43.72 
 
 		 472 aa  394  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  42.46 
 
 		 495 aa  388  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  38.73 
 
 		 582 aa  373  1e-102  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  39.48 
 
 		 581 aa  368  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  38.16 
 
 		 513 aa  354  2e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  37.05 
 
 		 561 aa  343  7e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  36.83 
 
 		 559 aa  334  3e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  34.42 
 
 		 608 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  33.27 
 
 		 471 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  33.81 
 
 		 445 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  32.45 
 
 		 447 aa  239  6.999999999999999e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  33.4 
 
 		 471 aa  237  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  33.81 
 
 		 441 aa  237  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  33.4 
 
 		 458 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  31.37 
 
 		 492 aa  231  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  27.62 
 
 		 436 aa  229  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  31.67 
 
 		 727 aa  217  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  32.02 
 
 		 465 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  30.25 
 
 		 442 aa  210  5e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  30.2 
 
 		 467 aa  210  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  30.59 
 
 		 530 aa  210  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  30.06 
 
 		 453 aa  209  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  29.32 
 
 		 776 aa  208  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  37.65 
 
 		 470 aa  206  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  37.42 
 
 		 459 aa  205  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  29.09 
 
 		 523 aa  203  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30 
 
 		 464 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  27.31 
 
 		 441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  28.91 
 
 		 706 aa  191  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  35.14 
 
 		 519 aa  183  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  28.39 
 
 		 543 aa  183  7e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  28.86 
 
 		 486 aa  183  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  27.59 
 
 		 479 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  35.99 
 
 		 588 aa  177  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  28.16 
 
 		 471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  28.43 
 
 		 455 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  29.28 
 
 		 481 aa  173  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  27.22 
 
 		 463 aa  169  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  27.82 
 
 		 474 aa  169  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 		 514 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  23.81 
 
 		 514 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 		 514 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  23 
 
 		 533 aa  91.3  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  28.64 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1683  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.08 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1759  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.25 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.32 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.19 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.8 
 
 		 336 aa  73.6  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0829  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.89 
 
 		 314 aa  73.2  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2030  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.37 
 
 		 334 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1830  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.72 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2100  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.88 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.84 
 
 		 332 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15625  predicted protein  28.79 
 
 		 335 aa  70.1  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.21 
 
 		 353 aa  70.1  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.989174  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.45 
 
 		 329 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  0.121323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1239  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.02 
 
 		 329 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.74 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.23 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1762  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.96 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.114768 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1339  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.32 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.37 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.81 
 
 		 316 aa  67  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.2 
 
 		 340 aa  67  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0378398  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.13 
 
 		 337 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1959  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.13 
 
 		 337 aa  66.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1937  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.13 
 
 		 337 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2244  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.03 
 
 		 326 aa  66.6  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1400  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.73 
 
 		 323 aa  66.6  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2133  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.13 
 
 		 337 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2435  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.65 
 
 		 340 aa  66.6  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.168492  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4633  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.27 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0510268  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  29.41 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.72 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50634  predicted protein  27.75 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.612985 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2166  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.13 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.77 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0240  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.17 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0882  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.98 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1648  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.79 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.918642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.56 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03862  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.55 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1320  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.9 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.89 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3175  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.44 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2177  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.32 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.697668  normal  0.807394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>