86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0419 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0419  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 337 aa  695    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0858  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2162  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 356 aa  105  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.211612  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2181  hypothetical protein  28.12 
 
 		 355 aa  97.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0928383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1175  radical SAM domain-containing protein  27.69 
 
 		 348 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.913807  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0891  hypothetical protein  27.34 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.416371  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2384  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1611  Radical SAM domain protein  27.96 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3720  radical SAM domain-containing protein  28.9 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.0048621  normal  0.524582 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3357  radical SAM family protein  29.96 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158709  normal  0.0575022 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1410  Radical SAM domain protein  26.73 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2216  metallo cofactor biosynthesis protein, conjectural  44.19 
 
 		 92 aa  67  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0171048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3375  radical SAM family protein  29.58 
 
 		 640 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0390  Radical SAM domain protein  31.62 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000824452  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  25.37 
 
 		 380 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2394  radical SAM domain-containing protein  30.3 
 
 		 333 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 501 aa  51.2  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07041  Fe-S oxidoreductase  24.38 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.156574  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 		 496 aa  50.8  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2884  Radical SAM domain protein  22.03 
 
 		 370 aa  50.4  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0663943  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  25.38 
 
 		 565 aa  50.1  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  29.48 
 
 		 332 aa  50.1  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3419  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.91 
 
 		 414 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058581  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0924  Radical SAM domain protein  31.01 
 
 		 340 aa  49.7  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1506  Radical SAM domain protein  30.48 
 
 		 333 aa  49.3  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  30.88 
 
 		 380 aa  49.3  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0683  Radical SAM domain protein  26.8 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 		 800 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0710  Radical SAM domain protein  26.8 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  36.9 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3061  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  33.04 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07461  Fe-S oxidoreductase  29.25 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.390345  normal  0.116185 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  28.78 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  28 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0638  hypothetical protein  28.67 
 
 		 310 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2025  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.49 
 
 		 348 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1154  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 		 377 aa  47.4  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.812273  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.17 
 
 		 325 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  29.01 
 
 		 472 aa  46.6  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6304  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.5 
 
 		 398 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1348  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 		 322 aa  46.6  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 		 333 aa  46.6  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1385  Radical SAM domain protein  35.48 
 
 		 417 aa  46.2  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0362532  unclonable  0.0000106904 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5883  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 		 332 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1282  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.78 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.591085  normal  0.574415 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.2 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155054 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  23.55 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.66 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  31.52 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1915  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.43 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  32.43 
 
 		 409 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07011  Fe-S oxidoreductases  36.51 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  37.25 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0078  hypothetical protein  36.51 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2577  radical SAM domain-containing protein  33.85 
 
 		 371 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.014973  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.11 
 
 		 308 aa  44.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.17 
 
 		 321 aa  44.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1990  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.27 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  25.4 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.99 
 
 		 392 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601943  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  31.91 
 
 		 314 aa  43.5  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  29.17 
 
 		 336 aa  43.5  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1017  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 		 332 aa  43.5  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 316 aa  43.5  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  34.09 
 
 		 579 aa  43.5  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 389 aa  43.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  28.06 
 
 		 380 aa  43.5  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0401  YfkB-like domain-containing protein  30.23 
 
 		 375 aa  43.1  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0087  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.14 
 
 		 337 aa  43.1  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0823878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5327  coproporphyrinogen III oxidase  26.9 
 
 		 401 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4663  Radical SAM domain protein  27.5 
 
 		 381 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0193587 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.84 
 
 		 345 aa  42.7  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.53 
 
 		 345 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.85 
 
 		 317 aa  43.1  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0414  radical SAM domain-containing protein  31.65 
 
 		 330 aa  42.7  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.910572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2247  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.49 
 
 		 348 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1968  Radical SAM domain protein  26.77 
 
 		 458 aa  42.7  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  25.26 
 
 		 335 aa  42.7  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  23.55 
 
 		 332 aa  42.7  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 418 aa  42.7  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02372  coproporphyrinogen III oxidase  27.12 
 
 		 385 aa  42.7  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>