More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0087 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0087  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  100 
 
 
337 aa  699    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0823878  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  86.65 
 
 
337 aa  622  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.62159  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4402  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  89.88 
 
 
326 aa  620  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320325  hitchhiker  0.00467523 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0285  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  86.05 
 
 
337 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0281  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  86.05 
 
 
337 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0284  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  86.05 
 
 
337 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4793  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  89.88 
 
 
326 aa  614  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113371  hitchhiker  0.00000239799 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4120  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  89.26 
 
 
326 aa  614  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0277  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  86.05 
 
 
337 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0274  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  85.16 
 
 
337 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.481355  hitchhiker  0.000000283417 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  84.57 
 
 
337 aa  607  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000395705 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3524  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  83.88 
 
 
340 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.406525  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3748  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  84.27 
 
 
337 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.247867  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  83.98 
 
 
337 aa  597  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4452  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  85.89 
 
 
326 aa  596  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0101  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  75.37 
 
 
337 aa  536  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.012034  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002954  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  63.22 
 
 
329 aa  441  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.761201  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1877  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  63.22 
 
 
329 aa  442  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02954  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  63.53 
 
 
329 aa  442  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2922  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  61.35 
 
 
326 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.347624  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1434  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  61.35 
 
 
326 aa  433  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1320  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  61.77 
 
 
327 aa  432  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155131  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2836  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  61.35 
 
 
326 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0544  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  62.61 
 
 
334 aa  432  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2862  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  59.36 
 
 
340 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0111085  normal  0.0131262 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00748  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  59.21 
 
 
329 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2861  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  59.21 
 
 
329 aa  414  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.228383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0835  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  59.21 
 
 
329 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.344402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0844  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  59.21 
 
 
329 aa  414  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0987442  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00765  hypothetical protein  59.21 
 
 
329 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  59.21 
 
 
329 aa  414  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1031  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.45 
 
 
338 aa  412  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0929  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  59.21 
 
 
329 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2571  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.91 
 
 
329 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2435  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.35 
 
 
340 aa  408  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.168492  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2177  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.41 
 
 
339 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.697668  normal  0.807394 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0865  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.01 
 
 
329 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.01 
 
 
329 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0837  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.01 
 
 
329 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0896  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.7 
 
 
329 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0928  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.7 
 
 
329 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2526  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.35 
 
 
340 aa  398  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2952  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  59.12 
 
 
340 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55.59 
 
 
340 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0378398  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1512  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.24 
 
 
340 aa  396  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2160  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.51 
 
 
322 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4633  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  53.21 
 
 
323 aa  368  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0510268  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2244  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  50.61 
 
 
326 aa  339  5e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555933  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02199  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  52.7 
 
 
294 aa  324  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.24 
 
 
325 aa  323  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0217  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.09 
 
 
437 aa  299  4e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0712  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.69 
 
 
367 aa  296  5e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0611  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.56 
 
 
369 aa  290  2e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1282  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.43 
 
 
327 aa  285  7e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.591085  normal  0.574415 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03862  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.37 
 
 
280 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.63 
 
 
327 aa  243  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2076  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  38.91 
 
 
329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000199937  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3879  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.33 
 
 
327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.02 
 
 
327 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3972  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.72 
 
 
327 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  38.72 
 
 
327 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.79 
 
 
327 aa  235  6e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3884  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.76 
 
 
327 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4462  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.67 
 
 
327 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4267  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.67 
 
 
327 aa  231  9e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.67 
 
 
327 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.2 
 
 
328 aa  229  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0077  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.07 
 
 
327 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44970  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.13 
 
 
331 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.18 
 
 
332 aa  226  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.412863  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3826  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.13 
 
 
331 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1582  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.86 
 
 
349 aa  225  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.519622  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.2 
 
 
330 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.51 
 
 
328 aa  225  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0460197  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0925  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  39.46 
 
 
339 aa  223  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3906  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.63 
 
 
334 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2766  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.89 
 
 
331 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237766  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.98 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0143  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.39 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.391723 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.61 
 
 
326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.8 
 
 
335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.485207  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2268  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.62 
 
 
325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.35 
 
 
326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1949  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.4 
 
 
343 aa  217  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1239  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.27 
 
 
329 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2612  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  36.39 
 
 
327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.27 
 
 
329 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  0.121323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4597  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.29 
 
 
334 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1291  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.29 
 
 
334 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1315  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.06 
 
 
341 aa  216  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0056  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.56 
 
 
348 aa  215  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0808361  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3349  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.15 
 
 
346 aa  215  9e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366452  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3388  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.95 
 
 
332 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4099  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.89 
 
 
328 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.12 
 
 
336 aa  215  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.39 
 
 
353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.989174  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30330  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.28 
 
 
331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1759  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.73 
 
 
356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4127  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.95 
 
 
334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2357  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  36.89 
 
 
331 aa  213  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.719976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>