More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2658 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 210 aa  425  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  96.67 
 
 		 210 aa  416  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  97.14 
 
 		 210 aa  417  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  79.52 
 
 		 210 aa  352  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  52.68 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  48.06 
 
 		 212 aa  208  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  47.8 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  46.46 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  48.31 
 
 		 227 aa  203  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  49.27 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  44.88 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  44.29 
 
 		 213 aa  192  3e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  44.29 
 
 		 213 aa  192  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  47.32 
 
 		 214 aa  191  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  47.32 
 
 		 214 aa  191  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  45.41 
 
 		 217 aa  191  5e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  45.85 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  44.39 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  44.93 
 
 		 217 aa  188  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  45.89 
 
 		 213 aa  187  8e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  43.98 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  46.6 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  45.54 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  45.41 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  43.18 
 
 		 245 aa  185  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  46.12 
 
 		 264 aa  185  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  46.34 
 
 		 212 aa  185  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  45.63 
 
 		 226 aa  184  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  45.37 
 
 		 215 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  48.06 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  40.91 
 
 		 244 aa  182  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  47.32 
 
 		 215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  45.63 
 
 		 215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  44.88 
 
 		 215 aa  181  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  40.45 
 
 		 244 aa  180  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  44.66 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  45.37 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  44.17 
 
 		 215 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  44.34 
 
 		 216 aa  177  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  44.17 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  44.17 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  47.59 
 
 		 193 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  42.25 
 
 		 211 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  40.58 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  39.32 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  43.9 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  43.14 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  42.86 
 
 		 202 aa  154  7e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  35.32 
 
 		 226 aa  150  8.999999999999999e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  35.32 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  41.87 
 
 		 202 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  35 
 
 		 223 aa  145  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  35.51 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  34.4 
 
 		 220 aa  138  7e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  40.6 
 
 		 253 aa  136  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  34.4 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  36.95 
 
 		 202 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  33.18 
 
 		 223 aa  128  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  32.39 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  33.48 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  32.54 
 
 		 208 aa  98.6  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  31.4 
 
 		 195 aa  95.5  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  33.19 
 
 		 235 aa  94.7  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  33.81 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  30.88 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  48.48 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  34.12 
 
 		 216 aa  92.4  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  44.86 
 
 		 258 aa  88.6  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  36.15 
 
 		 211 aa  88.2  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  44.04 
 
 		 274 aa  88.2  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  47.57 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  45.1 
 
 		 280 aa  87.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  42.59 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3134  organic radical activating enzyme-like protein  43.33 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260686 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2504  organic radical activating enzymes-like  43.33 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  43.33 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  32.34 
 
 		 235 aa  86.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  36 
 
 		 245 aa  85.9  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  33.48 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  33.48 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  33.48 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  33.48 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  33.48 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  33.48 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  33.48 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  31.43 
 
 		 216 aa  85.1  7e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  35.75 
 
 		 227 aa  84.7  8e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6469  organic radical activating-like protein  42.5 
 
 		 210 aa  84.7  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  42.5 
 
 		 210 aa  84.7  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  42.5 
 
 		 210 aa  84.7  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0138  hypothetical protein  41.67 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620978  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  34 
 
 		 192 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  34.78 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  30.9 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  31.3 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  40.83 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0526  hypothetical protein  41.67 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313091  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3115  organic radical activating enzyme-like protein  43.33 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.369286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  47.57 
 
 		 216 aa  81.3  0.000000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  35.75 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>