More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3158 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3158  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  100 
 
 		 382 aa  801    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3245  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  78.01 
 
 		 382 aa  637    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4168  putative hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein  69.07 
 
 		 388 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159717  normal  0.0664961 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4899  radical SAM family protein  68.32 
 
 		 386 aa  565  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152748  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3252  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  69.38 
 
 		 386 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.309315 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0017  MoaA/NifB/PqqE family protein  69.84 
 
 		 384 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4877  radical SAM domain-containing protein  68.56 
 
 		 386 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5424  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  68.56 
 
 		 386 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1268  radical SAM domain-containing protein  66.93 
 
 		 386 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1963  radical SAM domain-containing protein  66.93 
 
 		 386 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0981  radical SAM domain-containing protein  66.93 
 
 		 386 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820842  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3055  radical SAM domain-containing protein  66.93 
 
 		 386 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7035  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  69.29 
 
 		 384 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000165617 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5307  radical SAM family protein  68.56 
 
 		 386 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5553  radical SAM domain-containing protein  68.56 
 
 		 386 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2243  radical SAM domain-containing protein  66.93 
 
 		 386 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2930  radical SAM domain-containing protein  66.93 
 
 		 386 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4719  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  68.29 
 
 		 386 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0105  radical SAM oxidoreductase  67.75 
 
 		 386 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4131  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  68.96 
 
 		 381 aa  552  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1831  radical SAM domain-containing protein  66.76 
 
 		 383 aa  546  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7158  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  66.93 
 
 		 384 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2244  radical SAM domain-containing protein  69.69 
 
 		 371 aa  541  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0969  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  67.84 
 
 		 387 aa  541  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3460  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  67.03 
 
 		 387 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6342  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  66.67 
 
 		 384 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3658  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  67.3 
 
 		 387 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3768  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  67.03 
 
 		 387 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1287  radical SAM domain-containing protein  67.4 
 
 		 371 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1288  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  64.95 
 
 		 392 aa  518  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2267  Fe-S oxidoreductase  59.24 
 
 		 389 aa  487  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2971  hypothetical protein  58.01 
 
 		 382 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0553904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2680  radical SAM family protein  59.24 
 
 		 389 aa  488  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150776  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0060  radical SAM family protein  61.2 
 
 		 387 aa  484  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0850532  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1725  radical SAM family protein  55.38 
 
 		 383 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0670141 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3571  radical SAM family protein  56.68 
 
 		 386 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1745  oxidoreductase  61.3 
 
 		 372 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4256  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  56.95 
 
 		 386 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.59824  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2115  radical SAM domain protein  59.71 
 
 		 367 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1774  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  59.71 
 
 		 367 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1728  radical SAM family protein  57.07 
 
 		 388 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.791785  normal  0.0366359 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0815  MoaA/NifB/PqqE family protein  59.71 
 
 		 371 aa  449  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20630  MoaA, NifB, PqqE, radical SAM superfamily protein  58.45 
 
 		 377 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2560  radical SAM family protein  58.31 
 
 		 369 aa  435  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0538253  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0826  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  55.15 
 
 		 337 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.256838 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3361  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  50.54 
 
 		 402 aa  381  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.941975  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2847  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  53.42 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1015  radical SAM family Fe-S protein  54.04 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0391907  normal  0.466336 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3249  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  53.42 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.792504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2079  MoaA/NifB/PqqE family Fe-S oxidoreductase  48.8 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1219  radical SAM family protein  55.25 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3457  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  53.98 
 
 		 339 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483459 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4083  radical SAM domain-containing protein  54.73 
 
 		 336 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179922 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0220  radical SAM family protein  52.47 
 
 		 340 aa  363  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6662  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  51.26 
 
 		 334 aa  358  6e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.549457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1699  radical SAM domain-containing protein  51.26 
 
 		 334 aa  355  8.999999999999999e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.440195  hitchhiker  0.000169379 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0827  radical SAM family protein  48.29 
 
 		 334 aa  334  1e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.731351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2595  radical SAM family protein  49.06 
 
 		 332 aa  331  1e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.90136  normal  0.0805169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6192  radical SAM domain-containing protein  48.11 
 
 		 332 aa  329  6e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0225613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5711  radical SAM domain-containing protein  49.51 
 
 		 335 aa  326  5e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23060  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  48.43 
 
 		 334 aa  317  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.1711 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0865  radical SAM domain-containing protein  41.18 
 
 		 331 aa  299  6e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1192  radical SAM domain-containing protein  40.79 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1017  radical SAM domain-containing protein  40.79 
 
 		 332 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2236  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  39.75 
 
 		 333 aa  288  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2823  radical SAM family protein  41.43 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0411588 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2446  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  42.01 
 
 		 336 aa  276  6e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0685  radical SAM domain-containing protein  40.5 
 
 		 332 aa  273  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0882  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  39.27 
 
 		 332 aa  272  9e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000626988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3363  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  39.27 
 
 		 332 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3273  radical SAM domain-containing protein  49.23 
 
 		 157 aa  132  7.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347908  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  28.39 
 
 		 338 aa  90.5  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.02 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  29.02 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  29.03 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  27.24 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  28.63 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  28.22 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  28.1 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  26.43 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  26.84 
 
 		 387 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  26.01 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  30.41 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  26.85 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  27.62 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  25.7 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  26.85 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  30.25 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  24.77 
 
 		 373 aa  67  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  28.41 
 
 		 366 aa  67  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  27.36 
 
 		 422 aa  67  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  31.62 
 
 		 359 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  29.87 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  27.5 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  23.38 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  31.13 
 
 		 496 aa  64.3  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  31.85 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>