More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5553 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1268  radical SAM domain-containing protein  93.01 
 
 		 386 aa  762    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1963  radical SAM domain-containing protein  93.01 
 
 		 386 aa  762    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4899  radical SAM family protein  80 
 
 		 386 aa  655    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152748  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4719  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  99.74 
 
 		 386 aa  806    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1287  radical SAM domain-containing protein  92.72 
 
 		 371 aa  731    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0105  radical SAM oxidoreductase  95.23 
 
 		 386 aa  761    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0981  radical SAM domain-containing protein  93.01 
 
 		 386 aa  762    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820842  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3252  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  95.85 
 
 		 386 aa  783    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.309315 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2244  radical SAM domain-containing protein  92.99 
 
 		 371 aa  733    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5424  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  96.37 
 
 		 386 aa  785    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0017  MoaA/NifB/PqqE family protein  87.05 
 
 		 384 aa  715    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2243  radical SAM domain-containing protein  93.01 
 
 		 386 aa  762    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7035  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  87.24 
 
 		 384 aa  720    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000165617 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3055  radical SAM domain-containing protein  93.01 
 
 		 386 aa  762    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4168  putative hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein  79.79 
 
 		 388 aa  661    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159717  normal  0.0664961 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5307  radical SAM family protein  100 
 
 		 386 aa  808    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4877  radical SAM domain-containing protein  96.37 
 
 		 386 aa  785    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4131  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  87.07 
 
 		 381 aa  710    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5553  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 386 aa  808    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2930  radical SAM domain-containing protein  93.01 
 
 		 386 aa  762    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3245  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  70.13 
 
 		 382 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1831  radical SAM domain-containing protein  70.51 
 
 		 383 aa  580  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3158  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  68.56 
 
 		 382 aa  558  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0969  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  66.41 
 
 		 387 aa  548  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7158  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  67.53 
 
 		 384 aa  548  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3768  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  65.63 
 
 		 387 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3460  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  65.63 
 
 		 387 aa  546  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3658  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  65.63 
 
 		 387 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6342  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  68.36 
 
 		 384 aa  547  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2971  hypothetical protein  63.8 
 
 		 382 aa  541  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0553904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1288  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  66.03 
 
 		 392 aa  536  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0060  radical SAM family protein  65.4 
 
 		 387 aa  530  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0850532  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2267  Fe-S oxidoreductase  62.7 
 
 		 389 aa  525  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1725  radical SAM family protein  61.3 
 
 		 383 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0670141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2680  radical SAM family protein  62.7 
 
 		 389 aa  525  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150776  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4256  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  63.14 
 
 		 386 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.59824  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3571  radical SAM family protein  62.16 
 
 		 386 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1728  radical SAM family protein  60 
 
 		 388 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.791785  normal  0.0366359 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1745  oxidoreductase  64.08 
 
 		 372 aa  488  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2115  radical SAM domain protein  62.02 
 
 		 367 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1774  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  62.02 
 
 		 367 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20630  MoaA, NifB, PqqE, radical SAM superfamily protein  58.56 
 
 		 377 aa  470  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2560  radical SAM family protein  62.28 
 
 		 369 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0538253  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0815  MoaA/NifB/PqqE family protein  60.58 
 
 		 371 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2847  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  59.63 
 
 		 338 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3249  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  59.63 
 
 		 338 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.792504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3457  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  60.06 
 
 		 339 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483459 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0826  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  57.49 
 
 		 337 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.256838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2079  MoaA/NifB/PqqE family Fe-S oxidoreductase  51.5 
 
 		 336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3361  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  57.23 
 
 		 402 aa  406  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.941975  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1219  radical SAM family protein  58.02 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1699  radical SAM domain-containing protein  54.33 
 
 		 334 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.440195  hitchhiker  0.000169379 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0220  radical SAM family protein  57.63 
 
 		 340 aa  394  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1015  radical SAM family Fe-S protein  54.15 
 
 		 366 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0391907  normal  0.466336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4083  radical SAM domain-containing protein  56.76 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6662  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  50.75 
 
 		 334 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.549457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2595  radical SAM family protein  52.55 
 
 		 332 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.90136  normal  0.0805169 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0827  radical SAM family protein  49.55 
 
 		 334 aa  363  3e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.731351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6192  radical SAM domain-containing protein  49.55 
 
 		 332 aa  361  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0225613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5711  radical SAM domain-containing protein  49.85 
 
 		 335 aa  353  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23060  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  49.55 
 
 		 334 aa  350  3e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.1711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1017  radical SAM domain-containing protein  44.65 
 
 		 332 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0865  radical SAM domain-containing protein  41.96 
 
 		 331 aa  300  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2823  radical SAM family protein  44.65 
 
 		 332 aa  297  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0411588 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0685  radical SAM domain-containing protein  44.65 
 
 		 332 aa  297  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460157  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2446  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  44.95 
 
 		 336 aa  296  5e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1192  radical SAM domain-containing protein  42.59 
 
 		 332 aa  294  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2236  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  41.82 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3363  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  43.71 
 
 		 332 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0882  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  43.4 
 
 		 332 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000626988 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3273  radical SAM domain-containing protein  53.08 
 
 		 157 aa  147  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347908  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  24.17 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  27.49 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  29.07 
 
 		 418 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  26.14 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  28.27 
 
 		 565 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1760  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.9 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.41 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2045  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.9 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  30.63 
 
 		 393 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  29.03 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  25.44 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  23.67 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  25.91 
 
 		 487 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  24.89 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.09 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 496 aa  64.3  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  26.83 
 
 		 465 aa  64.3  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  27.74 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  23.71 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  25.62 
 
 		 491 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0177  hypothetical protein  29.26 
 
 		 471 aa  63.2  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  30.25 
 
 		 501 aa  63.2  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  25.13 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 		 395 aa  62.8  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  29.5 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>