More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0826 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0826  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  100 
 
 
337 aa  707    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.256838 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2847  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  80.36 
 
 
338 aa  591  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3249  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  80.36 
 
 
338 aa  591  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.792504  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1219  radical SAM family protein  78.04 
 
 
338 aa  570  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3457  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  78.87 
 
 
339 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0220  radical SAM family protein  73.21 
 
 
340 aa  550  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3361  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  61.95 
 
 
402 aa  454  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.941975  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1015  radical SAM family Fe-S protein  60.37 
 
 
366 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0391907  normal  0.466336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4083  radical SAM domain-containing protein  62.24 
 
 
336 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.179922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1725  radical SAM family protein  61.33 
 
 
383 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0670141 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3571  radical SAM family protein  61.14 
 
 
386 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22168  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2971  hypothetical protein  60.73 
 
 
382 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0553904  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5424  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  57.66 
 
 
386 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4877  radical SAM domain-containing protein  58.08 
 
 
386 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481897  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4719  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  57.49 
 
 
386 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4899  radical SAM family protein  58.38 
 
 
386 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152748  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2267  Fe-S oxidoreductase  60.49 
 
 
389 aa  412  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2680  radical SAM family protein  59.88 
 
 
389 aa  412  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150776  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5307  radical SAM family protein  57.49 
 
 
386 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5553  radical SAM domain-containing protein  57.49 
 
 
386 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3055  radical SAM domain-containing protein  56.12 
 
 
386 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2243  radical SAM domain-containing protein  56.12 
 
 
386 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1963  radical SAM domain-containing protein  56.12 
 
 
386 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2930  radical SAM domain-containing protein  56.12 
 
 
386 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3252  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  58.02 
 
 
386 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.309315 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0105  radical SAM oxidoreductase  58.2 
 
 
386 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2560  radical SAM family protein  57.36 
 
 
369 aa  408  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0538253  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0981  radical SAM domain-containing protein  56.12 
 
 
386 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1268  radical SAM domain-containing protein  56.12 
 
 
386 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0017  MoaA/NifB/PqqE family protein  56.55 
 
 
384 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4256  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  61.45 
 
 
386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.59824  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4168  putative hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein  56.59 
 
 
388 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159717  normal  0.0664961 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3245  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  55.39 
 
 
382 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4131  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  58.01 
 
 
381 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7035  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  55.95 
 
 
384 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000165617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20630  MoaA, NifB, PqqE, radical SAM superfamily protein  53.69 
 
 
377 aa  398  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1745  oxidoreductase  56.79 
 
 
372 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2244  radical SAM domain-containing protein  57.5 
 
 
371 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1728  radical SAM family protein  60.54 
 
 
388 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.791785  normal  0.0366359 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1831  radical SAM domain-containing protein  56.4 
 
 
383 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1287  radical SAM domain-containing protein  56.88 
 
 
371 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1288  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  57.23 
 
 
392 aa  393  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0060  radical SAM family protein  56.04 
 
 
387 aa  389  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0850532  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3158  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  55.15 
 
 
382 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0815  MoaA/NifB/PqqE family protein  54.29 
 
 
371 aa  381  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6662  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  52.65 
 
 
334 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.549457  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2079  MoaA/NifB/PqqE family Fe-S oxidoreductase  53.11 
 
 
336 aa  381  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1699  radical SAM domain-containing protein  56.25 
 
 
334 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.440195  hitchhiker  0.000169379 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1774  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  53.59 
 
 
367 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0827  radical SAM family protein  53.75 
 
 
334 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.731351  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2115  radical SAM domain protein  53.59 
 
 
367 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6342  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  54.91 
 
 
384 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00364932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3658  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  54.29 
 
 
387 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7158  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  54.6 
 
 
384 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2595  radical SAM family protein  54.86 
 
 
332 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.90136  normal  0.0805169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3460  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  54.29 
 
 
387 aa  373  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3768  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  54.29 
 
 
387 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5711  radical SAM domain-containing protein  54.69 
 
 
335 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0969  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  53.99 
 
 
387 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6192  radical SAM domain-containing protein  52.66 
 
 
332 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0225613 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23060  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  52.53 
 
 
334 aa  355  7.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.1711 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2446  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  45.99 
 
 
336 aa  324  1e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1192  radical SAM domain-containing protein  43.26 
 
 
332 aa  308  9e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2823  radical SAM family protein  44.55 
 
 
332 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0411588 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0685  radical SAM domain-containing protein  45.51 
 
 
332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1017  radical SAM domain-containing protein  42.68 
 
 
332 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3363  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  41.69 
 
 
332 aa  292  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0865  radical SAM domain-containing protein  41.85 
 
 
331 aa  291  8e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0882  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  41.07 
 
 
332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000626988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2236  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  42.49 
 
 
333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3273  radical SAM domain-containing protein  65.38 
 
 
157 aa  192  8e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347908  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  27.94 
 
 
387 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  27.94 
 
 
387 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  27.76 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  28.07 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  26.43 
 
 
410 aa  79.3  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13126  molybdenum cofactor biosynthesis protein A moaA1  30.54 
 
 
359 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0851136 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  28.66 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  27.53 
 
 
338 aa  77  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.81 
 
 
399 aa  77  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0323  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  26.77 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  29.8 
 
 
491 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 
418 aa  72.4  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 
319 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2198  radical SAM domain-containing protein  26.94 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0314345  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  28.28 
 
 
487 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  27.33 
 
 
399 aa  69.3  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
406 aa  69.3  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  30.19 
 
 
399 aa  69.3  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  25 
 
 
406 aa  69.3  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  29.19 
 
 
429 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  28.33 
 
 
407 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  30.11 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  26.14 
 
 
565 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 
1005 aa  67  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  29.68 
 
 
399 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1782  Radical SAM domain protein  23.36 
 
 
404 aa  67  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>