More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4131 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4719  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  87.34 
 
 		 386 aa  711    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0981  radical SAM domain-containing protein  90.57 
 
 		 386 aa  725    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1268  radical SAM domain-containing protein  90.57 
 
 		 386 aa  725    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1963  radical SAM domain-containing protein  90.57 
 
 		 386 aa  725    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4899  radical SAM family protein  80.63 
 
 		 386 aa  649    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152748  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1287  radical SAM domain-containing protein  90.83 
 
 		 371 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0105  radical SAM oxidoreductase  88.68 
 
 		 386 aa  707    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5424  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  88.68 
 
 		 386 aa  709    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2244  radical SAM domain-containing protein  90.56 
 
 		 371 aa  705    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2930  radical SAM domain-containing protein  90.57 
 
 		 386 aa  725    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0017  MoaA/NifB/PqqE family protein  91.29 
 
 		 384 aa  739    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2243  radical SAM domain-containing protein  90.57 
 
 		 386 aa  725    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3252  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  88.68 
 
 		 386 aa  708    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.309315 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4168  putative hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein  80.42 
 
 		 388 aa  651    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159717  normal  0.0664961 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5307  radical SAM family protein  87.07 
 
 		 386 aa  710    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4877  radical SAM domain-containing protein  86.81 
 
 		 386 aa  706    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3055  radical SAM domain-containing protein  90.57 
 
 		 386 aa  725    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5553  radical SAM domain-containing protein  87.07 
 
 		 386 aa  710    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4131  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  100 
 
 		 381 aa  800    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7035  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  91.56 
 
 		 384 aa  742    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000165617 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1831  radical SAM domain-containing protein  72.75 
 
 		 383 aa  589  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3245  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  70.37 
 
 		 382 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3158  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  68.96 
 
 		 382 aa  552  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6342  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  68 
 
 		 384 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7158  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  67.73 
 
 		 384 aa  535  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0969  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  67.21 
 
 		 387 aa  535  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2971  hypothetical protein  65.52 
 
 		 382 aa  533  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0553904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3768  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  66.4 
 
 		 387 aa  529  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3658  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  66.4 
 
 		 387 aa  530  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3460  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  66.4 
 
 		 387 aa  529  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0060  radical SAM family protein  66.12 
 
 		 387 aa  526  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0850532  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1288  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  66.48 
 
 		 392 aa  522  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2267  Fe-S oxidoreductase  64.75 
 
 		 389 aa  520  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1725  radical SAM family protein  62.99 
 
 		 383 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0670141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2680  radical SAM family protein  64.21 
 
 		 389 aa  519  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150776  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4256  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  65.93 
 
 		 386 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.59824  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3571  radical SAM family protein  62.04 
 
 		 386 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1728  radical SAM family protein  63.46 
 
 		 388 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.791785  normal  0.0366359 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1745  oxidoreductase  64.93 
 
 		 372 aa  491  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1774  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  61.6 
 
 		 367 aa  477  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2115  radical SAM domain protein  61.6 
 
 		 367 aa  477  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2560  radical SAM family protein  61.95 
 
 		 369 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0538253  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20630  MoaA, NifB, PqqE, radical SAM superfamily protein  60.58 
 
 		 377 aa  463  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0815  MoaA/NifB/PqqE family protein  60.7 
 
 		 371 aa  449  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2847  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  57.99 
 
 		 338 aa  411  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3249  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  57.99 
 
 		 338 aa  411  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.792504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0826  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  58.01 
 
 		 337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.256838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2079  MoaA/NifB/PqqE family Fe-S oxidoreductase  51.96 
 
 		 336 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3457  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  59.56 
 
 		 339 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483459 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3361  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  56.83 
 
 		 402 aa  398  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.941975  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1219  radical SAM family protein  57.05 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1699  radical SAM domain-containing protein  54.38 
 
 		 334 aa  388  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.440195  hitchhiker  0.000169379 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0220  radical SAM family protein  56.69 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1015  radical SAM family Fe-S protein  54.6 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0391907  normal  0.466336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6662  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  50.45 
 
 		 334 aa  371  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.549457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4083  radical SAM domain-containing protein  57.41 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179922 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0827  radical SAM family protein  50 
 
 		 334 aa  362  5.0000000000000005e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.731351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2595  radical SAM family protein  51.36 
 
 		 332 aa  362  5.0000000000000005e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.90136  normal  0.0805169 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23060  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  50.45 
 
 		 334 aa  352  5e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.1711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6192  radical SAM domain-containing protein  47.73 
 
 		 332 aa  348  9e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0225613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5711  radical SAM domain-containing protein  50.15 
 
 		 335 aa  348  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0865  radical SAM domain-containing protein  42.15 
 
 		 331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1017  radical SAM domain-containing protein  45.9 
 
 		 332 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2823  radical SAM family protein  46.23 
 
 		 332 aa  300  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0411588 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1192  radical SAM domain-containing protein  44.74 
 
 		 332 aa  301  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2446  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  45.28 
 
 		 336 aa  297  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0685  radical SAM domain-containing protein  45.57 
 
 		 332 aa  296  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460157  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2236  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  43.26 
 
 		 333 aa  294  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0882  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  45.25 
 
 		 332 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000626988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3363  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  44.92 
 
 		 332 aa  292  6e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3273  radical SAM domain-containing protein  49.19 
 
 		 157 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347908  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  27.1 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  27.39 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  26.6 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  26.97 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  26.23 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  26.6 
 
 		 491 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 		 565 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  25.59 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3061  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  20.06 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1760  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.17 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2045  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.17 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  25.24 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  25.91 
 
 		 487 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.76 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  23.99 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  24.55 
 
 		 410 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 338 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  29.88 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2102  Radical SAM domain protein  26.44 
 
 		 548 aa  62.4  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  27.71 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.55 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  29.37 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  28.89 
 
 		 468 aa  60.5  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  29.14 
 
 		 496 aa  60.1  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  30.25 
 
 		 501 aa  60.1  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>