More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2467 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
210 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  79.52 
 
 
210 aa  352  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  78.57 
 
 
210 aa  349  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  78.57 
 
 
210 aa  348  3e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  48.78 
 
 
212 aa  215  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  52.2 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  46.02 
 
 
226 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  44.76 
 
 
217 aa  202  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  44.76 
 
 
217 aa  199  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  44.76 
 
 
213 aa  198  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  47.8 
 
 
213 aa  198  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  44.76 
 
 
213 aa  198  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  49.76 
 
 
215 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  46.34 
 
 
227 aa  197  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  45.15 
 
 
212 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  49.05 
 
 
223 aa  194  9e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  44.39 
 
 
210 aa  192  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  45.85 
 
 
233 aa  193  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  47.89 
 
 
215 aa  192  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  47.09 
 
 
215 aa  192  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  47.32 
 
 
215 aa  191  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  46.6 
 
 
226 aa  191  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  46.83 
 
 
215 aa  190  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  45.85 
 
 
227 aa  188  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  45.41 
 
 
213 aa  188  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  46.83 
 
 
214 aa  187  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  46.83 
 
 
214 aa  187  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  46.12 
 
 
215 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  46.12 
 
 
264 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  43.56 
 
 
245 aa  183  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  45.71 
 
 
212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  43.48 
 
 
217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  45.15 
 
 
215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  43.48 
 
 
217 aa  182  3e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  45.15 
 
 
215 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  41.78 
 
 
244 aa  182  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  45.15 
 
 
215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  45.15 
 
 
215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  41.78 
 
 
244 aa  181  7e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  46.6 
 
 
216 aa  180  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  43.19 
 
 
211 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  43.87 
 
 
216 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  47.92 
 
 
193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  39.63 
 
 
223 aa  165  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  42.44 
 
 
232 aa  165  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  38.5 
 
 
209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  39.81 
 
 
234 aa  162  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  37.16 
 
 
222 aa  156  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  42.65 
 
 
202 aa  154  9e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  41.87 
 
 
202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  34.4 
 
 
226 aa  150  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  39.9 
 
 
202 aa  144  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  41.15 
 
 
253 aa  141  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  37.16 
 
 
220 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  34.58 
 
 
225 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  37.61 
 
 
223 aa  138  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  37.93 
 
 
202 aa  137  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  35.32 
 
 
223 aa  136  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  36.24 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  34.06 
 
 
230 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  33.49 
 
 
208 aa  99  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  50.46 
 
 
274 aa  97.4  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  30.29 
 
 
195 aa  95.9  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  31.48 
 
 
220 aa  95.9  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  37.26 
 
 
211 aa  94.7  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  36.28 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  47.47 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 
258 aa  92.4  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  46.79 
 
 
258 aa  92  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  48.54 
 
 
280 aa  90.9  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  34.42 
 
 
216 aa  89.4  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  31.38 
 
 
235 aa  87  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  33.65 
 
 
210 aa  87  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  29.25 
 
 
192 aa  85.9  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  44.44 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0318  queuosine biosynthesis protein QueE  34.73 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  33.18 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  33.64 
 
 
227 aa  81.6  0.000000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  47.57 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  40.83 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  46.46 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  35.16 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  34.29 
 
 
245 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1571  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 
246 aa  78.2  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  28.37 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3134  organic radical activating enzyme-like protein  40 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.260686 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2504  organic radical activating enzymes-like  40 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  40 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  30.24 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3149  hypothetical protein  32.05 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105264  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  30.24 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  26.54 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  33.33 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  29.56 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0526  hypothetical protein  43.33 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313091  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1899  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  33.33 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  33.71 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>