More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01723 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01723  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  784    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 		 468 aa  77  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  23.39 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  25.22 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  22.51 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  24.78 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  24.51 
 
 		 479 aa  69.7  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  21.17 
 
 		 323 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8971  Radical SAM domain protein  25.62 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  28.07 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  28.88 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  28.64 
 
 		 495 aa  67.4  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  24.48 
 
 		 501 aa  66.6  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  22.37 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  22.7 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  22.63 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  20.65 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 496 aa  63.2  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  25.79 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  24.05 
 
 		 361 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  27 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  22.69 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  26.81 
 
 		 512 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  23.27 
 
 		 326 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4009  radical SAM domain-containing protein  23.1 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.08 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  24.32 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1844  Radical SAM domain protein  25.75 
 
 		 453 aa  59.7  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115714  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0444  Radical SAM domain protein  22.15 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1002  Radical SAM domain protein  24.61 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 		 487 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1814  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  23.51 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  24.34 
 
 		 565 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  27.01 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  25.77 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  25.57 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  21.65 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  23.96 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  24.77 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  24.57 
 
 		 395 aa  57  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  22.93 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  23.32 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  22.61 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0591  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.58 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2548  radical SAM domain-containing protein  31.21 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  22.05 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  22.18 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  25.67 
 
 		 491 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3378  hypothetical protein  30.87 
 
 		 595 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 364 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  22.99 
 
 		 349 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  23.17 
 
 		 327 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4120  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.49 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  21.31 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  25.11 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  21.15 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  23.2 
 
 		 455 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  24.16 
 
 		 364 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.62 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  24.59 
 
 		 491 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  22.92 
 
 		 399 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 399 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  25.14 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  25 
 
 		 365 aa  54.7  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0277  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.5 
 
 		 337 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  23.38 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  25.71 
 
 		 391 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0284  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.5 
 
 		 337 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0281  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.5 
 
 		 337 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  22.16 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 330 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2641  Radical SAM domain protein  23.38 
 
 		 358 aa  54.3  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.587199  normal  0.0478342 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.5 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.62159  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  33.67 
 
 		 513 aa  54.3  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  26.23 
 
 		 1005 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  25.44 
 
 		 332 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 		 396 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  22.44 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  21.54 
 
 		 393 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0285  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.5 
 
 		 337 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  22.9 
 
 		 581 aa  53.9  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  22.44 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>