More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1814 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1002  Radical SAM domain protein  81.59 
 
 		 365 aa  648    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1814  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 369 aa  768    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1375  Fe-S oxidoreductase-like  66.94 
 
 		 377 aa  523  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.771753  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  25.3 
 
 		 376 aa  113  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  26.77 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  26.91 
 
 		 389 aa  97.1  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  25.63 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 		 418 aa  94.4  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  29.08 
 
 		 323 aa  92.8  9e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 		 323 aa  90.5  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  25.64 
 
 		 428 aa  90.1  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 		 367 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2461  Radical SAM domain protein  28.16 
 
 		 380 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  29.13 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  26.62 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2921  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.925202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  28.76 
 
 		 496 aa  83.6  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  25.22 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  22.67 
 
 		 474 aa  80.9  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1786  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  28.28 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  31.33 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  25.16 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  25.98 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  28.77 
 
 		 479 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1392  Radical SAM domain protein  23.92 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.358724 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  26.98 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  28.66 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  23.87 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2198  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0314345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  25.58 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  26.25 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 327 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  29.52 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  31.47 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  23.94 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0444  Radical SAM domain protein  24.22 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  25.45 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  25.15 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0608  coenzyme PQQ synthesis protein E  21.58 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.051547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1951  radical SAM family Fe-S protein  21.67 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.17 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601943  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  24.34 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2577  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.014973  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  24.12 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.33 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  23.49 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1935  radical SAM domain-containing protein  24.11 
 
 		 404 aa  72.8  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.100874 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  27.68 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  23.36 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  27.83 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  24.35 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  27.69 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  27.12 
 
 		 501 aa  72  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  24.33 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  23.93 
 
 		 561 aa  72  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0894  radical SAM domain-containing protein  24.5 
 
 		 320 aa  72  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.192099  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  26.22 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.51 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3419  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.49 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058581  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  29.19 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  29.19 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  28.32 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  25.38 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  23.42 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  29.78 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  26.46 
 
 		 482 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2586  radical SAM domain-containing protein  24.59 
 
 		 318 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  25.42 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  25.91 
 
 		 367 aa  69.3  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  23.16 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  25.84 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  30.14 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  30.67 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  25.16 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  30.59 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  29 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  24.85 
 
 		 470 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  24.91 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  28.12 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  31.37 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  28.73 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  24.72 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  24.76 
 
 		 491 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2033  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.45 
 
 		 395 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.455844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>