More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2461 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2461  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 380 aa  787    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1786  Radical SAM domain protein  74.46 
 
 		 377 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  25.6 
 
 		 390 aa  97.8  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  24.76 
 
 		 366 aa  94.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  26.17 
 
 		 510 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  25.89 
 
 		 377 aa  88.6  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  27.39 
 
 		 330 aa  87.8  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1814  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  26.35 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  25.64 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  27.25 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  27 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  27.19 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  25.36 
 
 		 393 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  27.19 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  24.61 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  23.63 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  24.63 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.8 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  23.63 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  22.62 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.05 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  24.64 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  25.89 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1002  Radical SAM domain protein  25.98 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  24.07 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  22.9 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  21.7 
 
 		 399 aa  76.3  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  25.24 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  23.77 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  24.76 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0426  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  32.1 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  25.6 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1375  Fe-S oxidoreductase-like  25.16 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.771753  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  25.37 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  23.55 
 
 		 480 aa  74.7  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  24.54 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  21.84 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  25.69 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  24.16 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  21.64 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  25.98 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 482 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  24.46 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  24.46 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  25.97 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  26.05 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  23.15 
 
 		 358 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 		 389 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  23.04 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  22.25 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  22.84 
 
 		 358 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  23.2 
 
 		 358 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  23.58 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  22.77 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  26.51 
 
 		 487 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  23.15 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2252  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.785698 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  24.01 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  22.25 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  24.19 
 
 		 479 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0244  Radical SAM domain protein  25.33 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0305821  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  21.99 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2586  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  23.75 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  22.89 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  24.69 
 
 		 769 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  23.05 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  23.57 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4537  Radical SAM domain protein  23.46 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0790  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.76 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 		 323 aa  67  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  22.46 
 
 		 393 aa  67  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  24.34 
 
 		 491 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3162  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.313662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2953  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 439 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.2 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  25.75 
 
 		 491 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  25.75 
 
 		 491 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  25.75 
 
 		 491 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  25.75 
 
 		 491 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  25.75 
 
 		 491 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  25.75 
 
 		 491 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>