More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6508 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 366 aa  753    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  27.53 
 
 		 367 aa  119  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  27.19 
 
 		 361 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  27.19 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  27.69 
 
 		 349 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  27.48 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  28.88 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  27.7 
 
 		 368 aa  103  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  26.65 
 
 		 561 aa  103  5e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  29.3 
 
 		 377 aa  102  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  28.28 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  27.54 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  29.35 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 		 429 aa  99.8  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  23.95 
 
 		 354 aa  99  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 		 399 aa  98.6  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  28.7 
 
 		 405 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.79 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  25.78 
 
 		 496 aa  97.4  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 384 aa  97.1  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  26.8 
 
 		 510 aa  96.7  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 316 aa  96.3  8e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  28.66 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 		 347 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  28.53 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2461  Radical SAM domain protein  24.76 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  32.3 
 
 		 397 aa  94  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 330 aa  94  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  28.43 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  32.43 
 
 		 391 aa  93.6  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  28.77 
 
 		 487 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 		 438 aa  92  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  29.55 
 
 		 418 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  30.41 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  28.3 
 
 		 382 aa  92.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  37.95 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  21.68 
 
 		 357 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  28.62 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  34.57 
 
 		 399 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  21.68 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3419  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  37.27 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058581  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  23.57 
 
 		 428 aa  91.3  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  31.12 
 
 		 378 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  31.12 
 
 		 377 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 		 358 aa  91.3  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  24.78 
 
 		 445 aa  90.9  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  22.01 
 
 		 358 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  27.56 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  23.66 
 
 		 393 aa  90.5  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  27.78 
 
 		 769 aa  90.5  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  29.45 
 
 		 405 aa  90.1  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  27.1 
 
 		 479 aa  90.1  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  21.68 
 
 		 358 aa  89.7  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  31.12 
 
 		 342 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  25.75 
 
 		 418 aa  89.7  8e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  22.04 
 
 		 356 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6304  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  35.85 
 
 		 398 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 		 380 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  33.13 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  30.61 
 
 		 377 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  30.81 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 		 491 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 		 491 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 		 491 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  27.84 
 
 		 491 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  27.1 
 
 		 383 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 		 491 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 		 491 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1786  Radical SAM domain protein  24.21 
 
 		 377 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 		 491 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1002  Radical SAM domain protein  25.99 
 
 		 365 aa  87.8  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2033  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  36.48 
 
 		 395 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  25.95 
 
 		 373 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0881  radical SAM family Fe-S protein  25.47 
 
 		 351 aa  87.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.730435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  23.29 
 
 		 358 aa  87.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  30.46 
 
 		 377 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2446  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  34.13 
 
 		 380 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121554  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  28.08 
 
 		 491 aa  87.4  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 		 394 aa  87.4  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  29.1 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0790  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  34.73 
 
 		 380 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  29.71 
 
 		 360 aa  87  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  28.39 
 
 		 335 aa  86.7  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  39.68 
 
 		 409 aa  86.3  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0883  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  34.18 
 
 		 399 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  30.34 
 
 		 390 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 333 aa  85.9  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  28.79 
 
 		 372 aa  85.9  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  30.25 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  24.76 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  31.07 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  24.51 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  24.5 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0195  radical SAM family protein  18.35 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.9 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  33.95 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>