More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1601 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  100 
 
 		 354 aa  738    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  28.62 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  23.92 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  25.73 
 
 		 340 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 		 341 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 355 aa  97.1  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  25.59 
 
 		 358 aa  96.7  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 322 aa  95.5  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  22.48 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  25.24 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  28.79 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  24.7 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  24.78 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  30.99 
 
 		 479 aa  73.6  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  27.23 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1002  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6304  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.94 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  28.25 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0848  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  20 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  24.4 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  27.19 
 
 		 474 aa  69.7  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0689  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.88 
 
 		 389 aa  69.3  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.62446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.09 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601943  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  23.04 
 
 		 496 aa  69.3  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  21.24 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  22.96 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  32.79 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1978  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  20.32 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.633092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0195  radical SAM family protein  24.3 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  28.19 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  28.65 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  24.19 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2359  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.4 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  30.58 
 
 		 396 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  24.36 
 
 		 380 aa  67  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  30.58 
 
 		 401 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  30.58 
 
 		 401 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  30.58 
 
 		 401 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  27.91 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  21.05 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  28.64 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3419  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.44 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058581  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0883  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.66 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  27.89 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  23.2 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2198  radical SAM domain-containing protein  21.36 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0314345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  21.93 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3748  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.13 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.247867  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  29.47 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  24.19 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  25.97 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  22.49 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  23.85 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.13 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000395705 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  23.26 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  28.64 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.13 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.62159  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  27.54 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0802  radical SAM domain-containing protein  20.68 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  28.67 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  28.32 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3033  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 468 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2372  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  29.7 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2817  Radical SAM domain protein  25.27 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  25.57 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0274  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.481355  hitchhiker  0.000000283417 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0285  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  25.11 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0284  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0277  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0281  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  28.66 
 
 		 341 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2033  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.32 
 
 		 395 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  27.57 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  25.08 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  27.06 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1814  radical SAM domain-containing protein  27.37 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4452  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  27.51 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4120  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.28 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  24.68 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3080  Radical SAM domain protein  26.11 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1915  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.26 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  25.97 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0087  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.28 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0823878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  25.97 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  27.81 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  31.06 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1326  hypothetical protein  24.19 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>