224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_346 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_346  serine/threonine protein phosphatase  100 
 
 
297 aa  623  1e-177  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0382  metallophosphoesterase  88.19 
 
 
259 aa  476  1e-133  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0403  Ser/Thr protein phosphatase family protein  88.02 
 
 
243 aa  456  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0808  metallophosphoesterase  42.21 
 
 
241 aa  193  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3343  metallophosphoesterase  41.3 
 
 
244 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4521  metallophosphoesterase  37.04 
 
 
244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.905481  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1085  metallophosphoesterase  37.96 
 
 
243 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.307111  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2290  metallophosphoesterase  41.09 
 
 
253 aa  170  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0846  metallophosphoesterase  37.14 
 
 
244 aa  169  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.537551  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2607  metallophosphoesterase  36.73 
 
 
244 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.783934 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1812  metallophosphoesterase  37.55 
 
 
244 aa  166  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1856  metallophosphoesterase  36.73 
 
 
252 aa  166  5e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.733001  normal  0.937707 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0413  metallophosphoesterase  37.4 
 
 
246 aa  159  5e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.636911  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3758  metallophosphoesterase  38.15 
 
 
248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1711  metallophosphoesterase  36.9 
 
 
247 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.341536  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5337  hypothetical protein  35.48 
 
 
246 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.274329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0910  metallophosphoesterase  36.03 
 
 
247 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3351  metallophosphoesterase  38.49 
 
 
249 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93526  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3700  metallophosphoesterase  37.45 
 
 
250 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3841  metallophosphoesterase  38.15 
 
 
248 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.255668  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2032  metallophosphoesterase  32.26 
 
 
250 aa  139  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.947793  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1489  metallophosphoesterase  35.2 
 
 
246 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0090  metallophosphoesterase  35.11 
 
 
263 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.681848  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3861  metallophosphoesterase  33.87 
 
 
246 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4162  metallophosphoesterase  32.65 
 
 
243 aa  136  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.159324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3031  putative serine/threonine phosphatase  31.2 
 
 
247 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0618  phosphoesterase protein  33.59 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1866  metallophosphoesterase  34.8 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144695  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2718  metallophosphoesterase  36.63 
 
 
241 aa  132  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.94 
 
 
222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3810  metallophosphoesterase  32.53 
 
 
246 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2263  metallophosphoesterase  33.86 
 
 
250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.985376  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1287  metallophosphoesterase  31.3 
 
 
241 aa  127  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000190987  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.66 
 
 
222 aa  126  4.0000000000000003e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  33.73 
 
 
222 aa  124  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  32.33 
 
 
254 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2227  metallophosphoesterase  31.43 
 
 
244 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.908069  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15841  hypothetical protein  32.05 
 
 
296 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2315  metallophosphoesterase  31.43 
 
 
244 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00926311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1633  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  31.43 
 
 
244 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00962274  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  32.33 
 
 
254 aa  123  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1568  hypothetical protein  32.69 
 
 
271 aa  122  5e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1957  phosphodiesterase  35.55 
 
 
240 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3845  metallophosphoesterase  32.96 
 
 
271 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2178  metallophosphoesterase  31.02 
 
 
244 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1737  metallophosphoesterase  31.76 
 
 
242 aa  118  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1760  metallophosphoesterase  32.05 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.645838  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0619  metallophosphoesterase  30.8 
 
 
265 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4611  metallophosphoesterase  30.5 
 
 
271 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11491  hypothetical protein  32.57 
 
 
271 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.112711 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1019  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.65 
 
 
223 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1710  metallophosphoesterase  31.84 
 
 
241 aa  117  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0540724  normal  0.136885 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2463  metallophosphoesterase  29.72 
 
 
291 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0422  metallophosphoesterase  35.96 
 
 
266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00658037  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.88 
 
 
219 aa  115  7.999999999999999e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1343  hypothetical protein  30.77 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3490  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  32.68 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0205997  normal  0.185531 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0140  putative serine/threonine protein phosphatase  34.16 
 
 
233 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0369  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.26 
 
 
223 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0867019  normal  0.227919 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0233  hypothetical protein  30.12 
 
 
264 aa  109  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4273  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  32.58 
 
 
252 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.894943 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  28.96 
 
 
239 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3469  serine/threonine protein phosphatase family protein  31.82 
 
 
245 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0649  metallophosphoesterase  32.13 
 
 
246 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381587  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1179  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.64 
 
 
235 aa  104  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0472  metallophosphoesterase  32.68 
 
 
252 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2071  metallophosphoesterase  30 
 
 
239 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654149  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0481  metallophosphoesterase  32.68 
 
 
252 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.26 
 
 
232 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  30.31 
 
 
238 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3372  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.2 
 
 
234 aa  102  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.26 
 
 
232 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0484  phosphodiesterase  29.43 
 
 
259 aa  100  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  32.21 
 
 
259 aa  99.8  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0757  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.5 
 
 
234 aa  99.4  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.496407 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.83 
 
 
227 aa  95.1  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1140  metallophosphoesterase  29.64 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.193072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2886  metallophosphoesterase  29.71 
 
 
268 aa  90.1  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.108757  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4423  metallophosphoesterase  26.57 
 
 
244 aa  89.4  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3084  metallophosphoesterase  26.57 
 
 
244 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1521  phosphoesterase  28.33 
 
 
225 aa  87  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1717  metallophosphoesterase  30.8 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.691923  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2789  serine/threonine protein phosphatase  31.28 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1363  metallophosphoesterase  26.85 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0352046  hitchhiker  0.00042748 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2046  metallophosphoesterase  29.22 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.489045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2857  phosphatase family protein  31.28 
 
 
247 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3071  phosphatase family protein  31.28 
 
 
247 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3080  phosphatase family protein  31.28 
 
 
247 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1957  CHAD domain containing protein  28.32 
 
 
681 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3065  phosphatase family protein  32.47 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3096  phosphatase family protein  31.28 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0003834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3099  phosphatase family protein  31.28 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.261836  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2829  serine/threonine protein phosphatase  31.28 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  28.63 
 
 
636 aa  81.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2851  metallophosphoesterase  30.86 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00538078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2182  phosphatase family protein  30.45 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.711182  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1106  metallophosphoesterase  29.73 
 
 
282 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000252416 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1877  metallophosphoesterase  28.63 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.823338  normal  0.551763 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0272  metallophosphoesterase  37.4 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.664692  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0139  metallophosphoesterase  26.47 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.18757  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>