146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3810 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_3810  metallophosphoesterase  100 
 
 
246 aa  510  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1489  metallophosphoesterase  75.61 
 
 
246 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3861  metallophosphoesterase  72.76 
 
 
246 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1866  metallophosphoesterase  73.58 
 
 
246 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5337  hypothetical protein  62.6 
 
 
246 aa  332  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.274329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0910  metallophosphoesterase  50.81 
 
 
247 aa  238  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3031  putative serine/threonine phosphatase  47.77 
 
 
247 aa  226  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0618  phosphoesterase protein  48.05 
 
 
256 aa  224  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2032  metallophosphoesterase  45.93 
 
 
250 aa  223  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.947793  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3490  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  47.41 
 
 
251 aa  218  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0205997  normal  0.185531 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3758  metallophosphoesterase  46.37 
 
 
248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4273  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  48.02 
 
 
252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.894943 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3841  metallophosphoesterase  45.97 
 
 
248 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.255668  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3700  metallophosphoesterase  45.97 
 
 
250 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3351  metallophosphoesterase  44.94 
 
 
249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93526  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0472  metallophosphoesterase  46.43 
 
 
252 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0481  metallophosphoesterase  46.43 
 
 
252 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3343  metallophosphoesterase  32.53 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_346  serine/threonine protein phosphatase  32.53 
 
 
297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1856  metallophosphoesterase  35.37 
 
 
252 aa  128  8.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.733001  normal  0.937707 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0649  metallophosphoesterase  36.47 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381587  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2290  metallophosphoesterase  36.6 
 
 
253 aa  125  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0619  metallophosphoesterase  33.74 
 
 
265 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0808  metallophosphoesterase  32.13 
 
 
241 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4521  metallophosphoesterase  36.55 
 
 
244 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.905481  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1085  metallophosphoesterase  28.92 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.307111  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0382  metallophosphoesterase  31.33 
 
 
259 aa  119  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0403  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.2 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1287  metallophosphoesterase  29.15 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000190987  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4611  metallophosphoesterase  30.47 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2178  metallophosphoesterase  32.14 
 
 
244 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2607  metallophosphoesterase  33.06 
 
 
244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.783934 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0846  metallophosphoesterase  32 
 
 
244 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.537551  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0233  hypothetical protein  32.11 
 
 
264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0090  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
263 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.681848  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1812  metallophosphoesterase  31.85 
 
 
244 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3845  metallophosphoesterase  31.56 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0422  metallophosphoesterase  30.95 
 
 
266 aa  109  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00658037  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1711  metallophosphoesterase  28.63 
 
 
247 aa  108  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.341536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1633  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  30.28 
 
 
244 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00962274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2227  metallophosphoesterase  29.88 
 
 
244 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.908069  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2315  metallophosphoesterase  29.48 
 
 
244 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00926311  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  32.81 
 
 
636 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1760  metallophosphoesterase  29.77 
 
 
255 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.645838  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1750  metallophosphoesterase  47.66 
 
 
113 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3469  serine/threonine protein phosphatase family protein  29.39 
 
 
245 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1957  phosphodiesterase  31.68 
 
 
240 aa  105  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2263  metallophosphoesterase  32.68 
 
 
250 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.985376  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2071  metallophosphoesterase  30.77 
 
 
239 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654149  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4162  metallophosphoesterase  27.56 
 
 
243 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.159324 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0413  metallophosphoesterase  27.35 
 
 
246 aa  102  5e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.636911  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11491  hypothetical protein  30.77 
 
 
271 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.112711 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.32 
 
 
222 aa  99.4  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1710  metallophosphoesterase  31.02 
 
 
241 aa  98.6  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0540724  normal  0.136885 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  30.04 
 
 
254 aa  98.6  8e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  31.2 
 
 
254 aa  98.6  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1737  metallophosphoesterase  32.26 
 
 
242 aa  98.6  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1343  hypothetical protein  30 
 
 
271 aa  97.8  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1019  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.28 
 
 
223 aa  97.4  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1568  hypothetical protein  30.92 
 
 
271 aa  96.7  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  27.86 
 
 
239 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15841  hypothetical protein  30.12 
 
 
296 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2718  metallophosphoesterase  29.6 
 
 
241 aa  94  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  29.72 
 
 
222 aa  90.9  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.92 
 
 
222 aa  89.4  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0140  putative serine/threonine protein phosphatase  31.98 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2463  metallophosphoesterase  26.6 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0369  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.31 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0867019  normal  0.227919 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.2 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3084  metallophosphoesterase  27.91 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4423  metallophosphoesterase  27.52 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3372  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.76 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0484  phosphodiesterase  25.86 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1179  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.23 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0656  metallophosphoesterase  26.91 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  28.57 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.22 
 
 
232 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.22 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1717  metallophosphoesterase  28.51 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.691923  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1521  phosphoesterase  25.81 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  26.14 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1957  CHAD domain containing protein  30.17 
 
 
681 aa  67.4  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1363  metallophosphoesterase  27.2 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0352046  hitchhiker  0.00042748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2886  metallophosphoesterase  23.85 
 
 
268 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.108757  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1140  metallophosphoesterase  26.79 
 
 
236 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.193072 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3065  phosphatase family protein  26.25 
 
 
247 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.02 
 
 
227 aa  62  0.000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1505  putative metallo-phosphoesterase  29.3 
 
 
251 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5302  metallophosphoesterase  28.63 
 
 
259 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8738  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0757  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.52 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.496407 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2857  phosphatase family protein  25.83 
 
 
247 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3071  phosphatase family protein  25.83 
 
 
247 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3080  phosphatase family protein  25.83 
 
 
247 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0870  metallophosphoesterase  27.16 
 
 
238 aa  58.9  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2789  serine/threonine protein phosphatase  25.1 
 
 
247 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3096  phosphatase family protein  25.1 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0003834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3099  phosphatase family protein  25.1 
 
 
247 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.261836  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0156  metallophosphoesterase  26.82 
 
 
251 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2021  metallophosphoesterase  25.62 
 
 
254 aa  56.6  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024092  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2829  serine/threonine protein phosphatase  25.42 
 
 
247 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>