214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0618 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0618  phosphoesterase protein  100 
 
 
256 aa  520  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5337  hypothetical protein  50.39 
 
 
246 aa  251  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.274329 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3861  metallophosphoesterase  49.22 
 
 
246 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1866  metallophosphoesterase  47.66 
 
 
246 aa  234  7e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144695  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3810  metallophosphoesterase  48.05 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1489  metallophosphoesterase  47.27 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0910  metallophosphoesterase  46.09 
 
 
247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3031  putative serine/threonine phosphatase  45.91 
 
 
247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3758  metallophosphoesterase  45.91 
 
 
248 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2032  metallophosphoesterase  41.25 
 
 
250 aa  206  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.947793  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3700  metallophosphoesterase  45.35 
 
 
250 aa  198  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3841  metallophosphoesterase  44.96 
 
 
248 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.255668  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3490  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  44.06 
 
 
251 aa  188  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0205997  normal  0.185531 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4273  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  45.42 
 
 
252 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.894943 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3351  metallophosphoesterase  43.36 
 
 
249 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93526  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0472  metallophosphoesterase  43.89 
 
 
252 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0481  metallophosphoesterase  43.89 
 
 
252 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1856  metallophosphoesterase  38.85 
 
 
252 aa  151  8.999999999999999e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.733001  normal  0.937707 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2290  metallophosphoesterase  38.6 
 
 
253 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0808  metallophosphoesterase  35.38 
 
 
241 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_346  serine/threonine protein phosphatase  33.59 
 
 
297 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0403  Ser/Thr protein phosphatase family protein  34.11 
 
 
243 aa  136  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1287  metallophosphoesterase  31.4 
 
 
241 aa  135  8e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000190987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4162  metallophosphoesterase  33.85 
 
 
243 aa  132  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.159324 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4521  metallophosphoesterase  38.7 
 
 
244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.905481  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0382  metallophosphoesterase  33.59 
 
 
259 aa  129  6e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3845  metallophosphoesterase  34.34 
 
 
271 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1711  metallophosphoesterase  34.21 
 
 
247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.341536  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4611  metallophosphoesterase  30.92 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2178  metallophosphoesterase  35.63 
 
 
244 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3343  metallophosphoesterase  32.68 
 
 
244 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0413  metallophosphoesterase  30.74 
 
 
246 aa  122  5e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.636911  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0649  metallophosphoesterase  34.85 
 
 
246 aa  122  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381587  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1085  metallophosphoesterase  29.46 
 
 
243 aa  122  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.307111  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0090  metallophosphoesterase  34.2 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.681848  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0422  metallophosphoesterase  32.95 
 
 
266 aa  118  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00658037  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1019  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.08 
 
 
223 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2607  metallophosphoesterase  33.97 
 
 
244 aa  116  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.783934 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0846  metallophosphoesterase  34.36 
 
 
244 aa  115  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.537551  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1812  metallophosphoesterase  33.97 
 
 
244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0619  metallophosphoesterase  32.69 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0369  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.46 
 
 
223 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0867019  normal  0.227919 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1710  metallophosphoesterase  33.59 
 
 
241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0540724  normal  0.136885 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1760  metallophosphoesterase  30.53 
 
 
255 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.645838  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1568  hypothetical protein  32.22 
 
 
271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2263  metallophosphoesterase  33.84 
 
 
250 aa  109  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.985376  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0140  putative serine/threonine protein phosphatase  31 
 
 
233 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0233  hypothetical protein  29.77 
 
 
264 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2227  metallophosphoesterase  32.57 
 
 
244 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.908069  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2315  metallophosphoesterase  32.18 
 
 
244 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00926311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1633  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  32.34 
 
 
244 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00962274  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15841  hypothetical protein  30.6 
 
 
296 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1343  hypothetical protein  30.66 
 
 
271 aa  106  5e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2718  metallophosphoesterase  32.03 
 
 
241 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2463  metallophosphoesterase  30.38 
 
 
291 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1957  phosphodiesterase  31.11 
 
 
240 aa  102  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11491  hypothetical protein  29.48 
 
 
271 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.112711 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 
222 aa  99.8  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2071  metallophosphoesterase  32.42 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654149  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.2 
 
 
219 aa  98.2  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3469  serine/threonine protein phosphatase family protein  31.13 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  28.74 
 
 
222 aa  96.7  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1737  metallophosphoesterase  32.55 
 
 
242 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.81 
 
 
222 aa  95.5  7e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  27.74 
 
 
254 aa  94.4  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  27.74 
 
 
254 aa  94  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3372  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.74 
 
 
234 aa  92.8  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0757  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.1 
 
 
234 aa  90.9  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.496407 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1750  metallophosphoesterase  41.44 
 
 
113 aa  90.9  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  26.91 
 
 
239 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0484  phosphodiesterase  28.31 
 
 
259 aa  87  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0656  metallophosphoesterase  30 
 
 
240 aa  86.3  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3084  metallophosphoesterase  25.9 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4423  metallophosphoesterase  25.27 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09700  predicted phosphoesterase  30.88 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  29.32 
 
 
636 aa  82  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  29.41 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.78 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5140  metallophosphoesterase  33.98 
 
 
244 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157126  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3065  phosphatase family protein  38.68 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.99 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.55 
 
 
232 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3461  metallophosphoesterase  38.18 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122821  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3080  phosphatase family protein  38.32 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2857  phosphatase family protein  38.32 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2789  serine/threonine protein phosphatase  38.32 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3071  phosphatase family protein  38.32 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5021  metallophosphoesterase  36.36 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.745206 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3096  phosphatase family protein  38.32 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0003834  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3115  metallophosphoesterase  36.36 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5252  metallophosphoesterase  36.36 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1717  metallophosphoesterase  29.37 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.691923  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4612  metallophosphoesterase  33.66 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0273  metallophosphoesterase  28.46 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1179  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.64 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2829  serine/threonine protein phosphatase  38.32 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2886  metallophosphoesterase  27.78 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.108757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2021  metallophosphoesterase  28.1 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024092  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5302  metallophosphoesterase  28.74 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8738  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3099  phosphatase family protein  37.38 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.261836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>