158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3861 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_3861  metallophosphoesterase  100 
 
 
246 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1489  metallophosphoesterase  89.43 
 
 
246 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1866  metallophosphoesterase  86.18 
 
 
246 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144695  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3810  metallophosphoesterase  72.76 
 
 
246 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5337  hypothetical protein  62.6 
 
 
246 aa  335  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.274329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0910  metallophosphoesterase  51.22 
 
 
247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0618  phosphoesterase protein  49.22 
 
 
256 aa  238  5.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3031  putative serine/threonine phosphatase  48.99 
 
 
247 aa  223  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2032  metallophosphoesterase  44.72 
 
 
250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.947793  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3758  metallophosphoesterase  47.37 
 
 
248 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4273  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  48.41 
 
 
252 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.894943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3490  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  45.82 
 
 
251 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0205997  normal  0.185531 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3700  metallophosphoesterase  46.96 
 
 
250 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3841  metallophosphoesterase  46.96 
 
 
248 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.255668  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3351  metallophosphoesterase  47.15 
 
 
249 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93526  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0472  metallophosphoesterase  45.63 
 
 
252 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0481  metallophosphoesterase  45.63 
 
 
252 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_346  serine/threonine protein phosphatase  33.87 
 
 
297 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0403  Ser/Thr protein phosphatase family protein  34.4 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1856  metallophosphoesterase  37.2 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.733001  normal  0.937707 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2178  metallophosphoesterase  33.73 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0382  metallophosphoesterase  33.6 
 
 
259 aa  125  6e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1711  metallophosphoesterase  33.2 
 
 
247 aa  124  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.341536  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3343  metallophosphoesterase  32.13 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4521  metallophosphoesterase  38.55 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.905481  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4162  metallophosphoesterase  31.76 
 
 
243 aa  116  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.159324 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0808  metallophosphoesterase  29.84 
 
 
241 aa  115  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1287  metallophosphoesterase  28.74 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000190987  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0422  metallophosphoesterase  29.84 
 
 
266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00658037  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2227  metallophosphoesterase  30.52 
 
 
244 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.908069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0619  metallophosphoesterase  31.58 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1633  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  30.04 
 
 
244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00962274  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2315  metallophosphoesterase  30.12 
 
 
244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00926311  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2290  metallophosphoesterase  33.58 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4611  metallophosphoesterase  30.74 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0649  metallophosphoesterase  32.16 
 
 
246 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381587  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0233  hypothetical protein  31.17 
 
 
264 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2263  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
250 aa  107  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.985376  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1085  metallophosphoesterase  27.49 
 
 
243 aa  105  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.307111  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0413  metallophosphoesterase  26.61 
 
 
246 aa  104  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.636911  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2607  metallophosphoesterase  31.33 
 
 
244 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.783934 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1737  metallophosphoesterase  32.79 
 
 
242 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3845  metallophosphoesterase  30.57 
 
 
271 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0090  metallophosphoesterase  31.27 
 
 
263 aa  101  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.681848  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1812  metallophosphoesterase  30.52 
 
 
244 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  28.52 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0846  metallophosphoesterase  30.12 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.537551  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1710  metallophosphoesterase  31.43 
 
 
241 aa  97.4  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0540724  normal  0.136885 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1019  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.8 
 
 
223 aa  96.7  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1957  phosphodiesterase  31.06 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  29.92 
 
 
254 aa  96.3  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  29.92 
 
 
254 aa  95.9  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  28.98 
 
 
636 aa  95.9  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3469  serine/threonine protein phosphatase family protein  28.16 
 
 
245 aa  95.5  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15841  hypothetical protein  30.89 
 
 
296 aa  95.1  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2071  metallophosphoesterase  30.36 
 
 
239 aa  95.1  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654149  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1750  metallophosphoesterase  41.23 
 
 
113 aa  95.1  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1343  hypothetical protein  30.38 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2463  metallophosphoesterase  28.91 
 
 
291 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11491  hypothetical protein  30.38 
 
 
271 aa  92.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.112711 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1568  hypothetical protein  31.25 
 
 
271 aa  92.4  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  28.11 
 
 
222 aa  89.7  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1760  metallophosphoesterase  26.32 
 
 
255 aa  89.4  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.645838  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2718  metallophosphoesterase  27.09 
 
 
241 aa  89  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.84 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.8 
 
 
222 aa  85.9  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0140  putative serine/threonine protein phosphatase  29.48 
 
 
233 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0369  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.42 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0867019  normal  0.227919 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.24 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0656  metallophosphoesterase  28.51 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0484  phosphodiesterase  25.76 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0757  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.76 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.496407 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1717  metallophosphoesterase  27.87 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.691923  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3372  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.48 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4423  metallophosphoesterase  25.2 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3084  metallophosphoesterase  25.2 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1505  putative metallo-phosphoesterase  28.35 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.27 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0156  metallophosphoesterase  28.63 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.27 
 
 
232 aa  72  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1363  metallophosphoesterase  27.2 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0352046  hitchhiker  0.00042748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2886  metallophosphoesterase  25.31 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.108757  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1957  CHAD domain containing protein  27.39 
 
 
681 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1179  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.05 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  23.6 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3480  metallophosphoesterase  26.36 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0474514  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0631  metallophosphoesterase  25.67 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  25.93 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1782  metallophosphoesterase  27.8 
 
 
235 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.865967  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1140  metallophosphoesterase  28.42 
 
 
236 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.193072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5302  metallophosphoesterase  28.69 
 
 
259 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8738  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4430  hypothetical protein  27.45 
 
 
246 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0537  metallophosphoesterase  25.19 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3460  phosphoesterase  24.47 
 
 
243 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0392151  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2771  metallophosphoesterase  25.21 
 
 
239 aa  59.7  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1521  phosphoesterase  23.58 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  21.28 
 
 
227 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0273  metallophosphoesterase  24.6 
 
 
281 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1656  metallophosphoesterase  29.25 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.865834  normal  0.107408 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3065  phosphatase family protein  24.8 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>