188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4612 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4612  metallophosphoesterase  100 
 
 
244 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5140  metallophosphoesterase  97.95 
 
 
244 aa  477  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157126  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3115  metallophosphoesterase  90.98 
 
 
244 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5252  metallophosphoesterase  90.98 
 
 
244 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0401  metallophosphoesterase  89.34 
 
 
244 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5021  metallophosphoesterase  90.57 
 
 
244 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.745206 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3461  metallophosphoesterase  88.93 
 
 
244 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122821  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3589  metallophosphoesterase  63.11 
 
 
247 aa  291  7e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.242712  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0264  metallophosphoesterase  55.92 
 
 
252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.662192 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1757  metallophosphoesterase  54.92 
 
 
246 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0201  metallophosphoesterase  53.54 
 
 
264 aa  248  9e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2118  metallophosphoesterase  54.1 
 
 
246 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1839  metallophosphoesterase  54.1 
 
 
246 aa  244  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0139  metallophosphoesterase  52.36 
 
 
260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.18757  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4135  metallophosphoesterase  50.21 
 
 
268 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0557704  hitchhiker  0.00370381 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0856  metallophosphoesterase  53.91 
 
 
246 aa  228  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0272546  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0673  hypothetical protein  51.84 
 
 
252 aa  222  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.293811  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3147  metallophosphoesterase  45.31 
 
 
246 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0093  hypothetical protein  47.33 
 
 
246 aa  205  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0537  metallophosphoesterase  45.68 
 
 
252 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3460  phosphoesterase  39.84 
 
 
243 aa  201  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0392151  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2883  metallophosphoesterase  44.86 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.134346 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0631  metallophosphoesterase  45.49 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3480  metallophosphoesterase  39.92 
 
 
243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0474514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3469  metallophosphoesterase  40.33 
 
 
243 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1505  putative metallo-phosphoesterase  45.27 
 
 
251 aa  191  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3115  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.82 
 
 
247 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.074661  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3492  hypothetical protein  46.09 
 
 
244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.494136 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0156  metallophosphoesterase  44.86 
 
 
251 aa  188  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3339  hypothetical protein  45.97 
 
 
248 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.201211  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4430  hypothetical protein  40.98 
 
 
246 aa  175  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3674  metallophosphoesterase  45.23 
 
 
249 aa  175  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.373546  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  30.77 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1957  phosphodiesterase  37.7 
 
 
240 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2813  metallophosphoesterase  38.1 
 
 
236 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3845  metallophosphoesterase  28.68 
 
 
271 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4611  metallophosphoesterase  27.56 
 
 
271 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  27.13 
 
 
254 aa  100  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  27.13 
 
 
254 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0870  metallophosphoesterase  34.8 
 
 
238 aa  99.8  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1879  metallophosphoesterase  34.02 
 
 
249 aa  99.4  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2886  metallophosphoesterase  35.15 
 
 
268 aa  99  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.108757  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.29 
 
 
222 aa  95.1  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.26 
 
 
232 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.39 
 
 
232 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0484  phosphodiesterase  27.64 
 
 
259 aa  93.2  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  31.94 
 
 
636 aa  92.8  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0619  metallophosphoesterase  32.62 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1957  CHAD domain containing protein  32.31 
 
 
681 aa  89.4  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  32.49 
 
 
222 aa  89  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3084  metallophosphoesterase  26.42 
 
 
244 aa  88.6  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1782  metallophosphoesterase  31.88 
 
 
235 aa  87.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.865967  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4423  metallophosphoesterase  25.61 
 
 
244 aa  87.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0168  metallophosphoesterase  33.47 
 
 
249 aa  86.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0808  metallophosphoesterase  27.74 
 
 
241 aa  86.3  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1019  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
223 aa  85.9  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0273  metallophosphoesterase  30.49 
 
 
281 aa  85.5  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2771  metallophosphoesterase  32.6 
 
 
239 aa  85.1  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  29.06 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  34.95 
 
 
238 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11491  hypothetical protein  31.38 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.112711 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1343  hypothetical protein  32.23 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09700  predicted phosphoesterase  32.28 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1568  hypothetical protein  31.28 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0369  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.51 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0867019  normal  0.227919 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1656  metallophosphoesterase  31.78 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.865834  normal  0.107408 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1174  metallophosphoesterase  36.27 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0750228  normal  0.054455 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1856  metallophosphoesterase  25.94 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.733001  normal  0.937707 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0233  hypothetical protein  25.91 
 
 
264 aa  78.6  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.8 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15841  hypothetical protein  28.96 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.29 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.17 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0618  phosphoesterase protein  33.66 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0422  metallophosphoesterase  30.38 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00658037  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2290  metallophosphoesterase  29.73 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0090  metallophosphoesterase  29.38 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.681848  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1877  metallophosphoesterase  32.35 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.823338  normal  0.551763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1106  metallophosphoesterase  31.2 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000252416 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0481  metallophosphoesterase  34.15 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2607  metallophosphoesterase  30.12 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.783934 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0472  metallophosphoesterase  34.15 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0656  metallophosphoesterase  27.66 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0403  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.75 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3351  metallophosphoesterase  38.71 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93526  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1649  metallophosphoesterase  35.64 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_346  serine/threonine protein phosphatase  27.39 
 
 
297 aa  68.6  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1737  metallophosphoesterase  29.64 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2829  metallophosphoesterase  27.11 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.979042  normal  0.209971 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1711  metallophosphoesterase  28.74 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.341536  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2263  metallophosphoesterase  32.48 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.985376  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0757  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.17 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.496407 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3469  serine/threonine protein phosphatase family protein  28.93 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1812  metallophosphoesterase  28.92 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0413  metallophosphoesterase  26.34 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.636911  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5337  hypothetical protein  29.24 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.274329 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2851  metallophosphoesterase  27.17 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00538078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3065  phosphatase family protein  26.09 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0382  metallophosphoesterase  27.39 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2829  serine/threonine protein phosphatase  26.09 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>