151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0093 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0093  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  500  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0631  metallophosphoesterase  64.63 
 
 
249 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2883  metallophosphoesterase  59.35 
 
 
246 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.134346 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3147  metallophosphoesterase  58.13 
 
 
246 aa  285  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3339  hypothetical protein  57.89 
 
 
248 aa  257  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.201211  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0537  metallophosphoesterase  49.19 
 
 
252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0856  metallophosphoesterase  51.43 
 
 
246 aa  248  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0272546  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3492  hypothetical protein  53.06 
 
 
244 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.494136 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1505  putative metallo-phosphoesterase  53.04 
 
 
251 aa  242  5e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0156  metallophosphoesterase  52.23 
 
 
251 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0401  metallophosphoesterase  47.33 
 
 
244 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4612  metallophosphoesterase  47.33 
 
 
244 aa  205  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5021  metallophosphoesterase  45.68 
 
 
244 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.745206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3115  metallophosphoesterase  45.68 
 
 
244 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5252  metallophosphoesterase  45.68 
 
 
244 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5140  metallophosphoesterase  46.5 
 
 
244 aa  201  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157126  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0201  metallophosphoesterase  43.36 
 
 
264 aa  201  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4135  metallophosphoesterase  47.33 
 
 
268 aa  198  6e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0557704  hitchhiker  0.00370381 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1757  metallophosphoesterase  45.9 
 
 
246 aa  194  9e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3461  metallophosphoesterase  46.5 
 
 
244 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122821  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0264  metallophosphoesterase  46.53 
 
 
252 aa  192  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.662192 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2118  metallophosphoesterase  45.08 
 
 
246 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0673  hypothetical protein  45.16 
 
 
252 aa  188  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.293811  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3589  metallophosphoesterase  46.31 
 
 
247 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.242712  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1839  metallophosphoesterase  44.67 
 
 
246 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3480  metallophosphoesterase  38.62 
 
 
243 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0474514  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0139  metallophosphoesterase  41.41 
 
 
260 aa  177  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.18757  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3460  phosphoesterase  37.4 
 
 
243 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0392151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3469  metallophosphoesterase  36.59 
 
 
243 aa  174  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3674  metallophosphoesterase  42.39 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.373546  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3115  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.51 
 
 
247 aa  156  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.074661  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4430  hypothetical protein  39.75 
 
 
246 aa  151  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2886  metallophosphoesterase  30.12 
 
 
268 aa  92.4  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.108757  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5302  metallophosphoesterase  31.75 
 
 
259 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8738  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1782  metallophosphoesterase  29.57 
 
 
235 aa  86.3  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.865967  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0656  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1879  metallophosphoesterase  32.76 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.57 
 
 
232 aa  82  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1957  phosphodiesterase  31.54 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  25.95 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.71 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1656  metallophosphoesterase  32.78 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.865834  normal  0.107408 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0484  phosphodiesterase  25.87 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0808  metallophosphoesterase  28.35 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  26.05 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3372  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.57 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  26.44 
 
 
259 aa  75.1  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  26.05 
 
 
254 aa  75.1  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0273  metallophosphoesterase  31.1 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4423  metallophosphoesterase  24.79 
 
 
244 aa  72  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0870  metallophosphoesterase  28.39 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1649  metallophosphoesterase  29.88 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3084  metallophosphoesterase  24.79 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  30.97 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0168  metallophosphoesterase  31.85 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2813  metallophosphoesterase  32.11 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3127  metallophosphoesterase  27.14 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.65 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1711  metallophosphoesterase  28.86 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.341536  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3065  phosphatase family protein  27.95 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2771  metallophosphoesterase  30.47 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2290  metallophosphoesterase  30.94 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2857  phosphatase family protein  27.85 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3071  phosphatase family protein  27.85 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.6 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3080  phosphatase family protein  27.85 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2789  serine/threonine protein phosphatase  27.43 
 
 
247 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3096  phosphatase family protein  27.43 
 
 
247 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0003834  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  31.28 
 
 
238 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3099  phosphatase family protein  27.73 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.261836  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2718  metallophosphoesterase  27.2 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0422  metallophosphoesterase  27.76 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00658037  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4273  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  29.66 
 
 
252 aa  67  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.894943 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.94 
 
 
227 aa  67  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2851  metallophosphoesterase  27 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00538078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2829  serine/threonine protein phosphatase  28.57 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2182  phosphatase family protein  27 
 
 
247 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.711182  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2829  metallophosphoesterase  25.86 
 
 
304 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.979042  normal  0.209971 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2046  metallophosphoesterase  26.47 
 
 
246 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.489045  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1737  metallophosphoesterase  29.55 
 
 
242 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1856  metallophosphoesterase  27.59 
 
 
252 aa  63.5  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.733001  normal  0.937707 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1760  metallophosphoesterase  30.53 
 
 
255 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.645838  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2032  metallophosphoesterase  27.86 
 
 
250 aa  63.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.947793  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  26.59 
 
 
636 aa  62.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5408  metallophosphoesterase  31.02 
 
 
247 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4611  metallophosphoesterase  26.1 
 
 
271 aa  62  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1757  hypothetical protein  26.36 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1710  metallophosphoesterase  28.05 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0540724  normal  0.136885 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1957  CHAD domain containing protein  24.78 
 
 
681 aa  60.1  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0369  phosphodiesterase, MJ0936 family  31 
 
 
223 aa  59.7  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0867019  normal  0.227919 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3031  putative serine/threonine phosphatase  27.48 
 
 
247 aa  58.9  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.11 
 
 
222 aa  58.5  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4162  metallophosphoesterase  25.96 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.159324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09700  predicted phosphoesterase  29.23 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11491  hypothetical protein  26.98 
 
 
271 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.112711 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1521  phosphoesterase  23.25 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_346  serine/threonine protein phosphatase  27.14 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2855  Ser/Thr protein phosphatase family  25.7 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0760224  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3490  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  29.34 
 
 
251 aa  57  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0205997  normal  0.185531 
 
 
-
 
NC_002936  DET0403  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.55 
 
 
243 aa  56.2  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>