147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3492 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3492  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  488  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.494136 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0631  metallophosphoesterase  51.84 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0093  hypothetical protein  53.06 
 
 
246 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2883  metallophosphoesterase  52.02 
 
 
246 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.134346 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3147  metallophosphoesterase  51.43 
 
 
246 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0537  metallophosphoesterase  48.77 
 
 
252 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0856  metallophosphoesterase  50.2 
 
 
246 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0272546  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1505  putative metallo-phosphoesterase  50.82 
 
 
251 aa  222  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3339  hypothetical protein  51 
 
 
248 aa  221  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.201211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0156  metallophosphoesterase  50.41 
 
 
251 aa  218  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3480  metallophosphoesterase  41.74 
 
 
243 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0474514  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0201  metallophosphoesterase  44.53 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3460  phosphoesterase  40.91 
 
 
243 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0392151  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0401  metallophosphoesterase  46.91 
 
 
244 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1757  metallophosphoesterase  47.56 
 
 
246 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1839  metallophosphoesterase  46.31 
 
 
246 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3469  metallophosphoesterase  39.75 
 
 
243 aa  195  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3115  metallophosphoesterase  46.53 
 
 
244 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5252  metallophosphoesterase  46.53 
 
 
244 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5021  metallophosphoesterase  46.12 
 
 
244 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.745206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4612  metallophosphoesterase  46.09 
 
 
244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3589  metallophosphoesterase  47.13 
 
 
247 aa  189  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.242712  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5140  metallophosphoesterase  45.68 
 
 
244 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157126  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3461  metallophosphoesterase  46.94 
 
 
244 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122821  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2118  metallophosphoesterase  44.26 
 
 
246 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0139  metallophosphoesterase  44.53 
 
 
260 aa  184  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.18757  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4135  metallophosphoesterase  46.09 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0557704  hitchhiker  0.00370381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0673  hypothetical protein  43.25 
 
 
252 aa  174  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.293811  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3115  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.14 
 
 
247 aa  164  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.074661  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0264  metallophosphoesterase  42.86 
 
 
252 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.662192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4430  hypothetical protein  40.56 
 
 
246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3674  metallophosphoesterase  42.8 
 
 
249 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.373546  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1879  metallophosphoesterase  31.51 
 
 
249 aa  86.3  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  32.51 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0168  metallophosphoesterase  33.68 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3127  metallophosphoesterase  28.5 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2886  metallophosphoesterase  28.34 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.108757  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3845  metallophosphoesterase  26.95 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  30.4 
 
 
636 aa  72  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2813  metallophosphoesterase  33.16 
 
 
236 aa  72  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0369  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.74 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0867019  normal  0.227919 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.91 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  26.15 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  26.15 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0808  metallophosphoesterase  25 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4423  metallophosphoesterase  27.31 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3084  metallophosphoesterase  27.31 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0870  metallophosphoesterase  28.89 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2771  metallophosphoesterase  29.13 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.48 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0656  metallophosphoesterase  31.9 
 
 
240 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1568  hypothetical protein  28.76 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1782  metallophosphoesterase  28.21 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.865967  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1737  metallophosphoesterase  25.87 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3372  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.42 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0619  metallophosphoesterase  25.48 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  25.96 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0403  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.63 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0422  metallophosphoesterase  26.36 
 
 
266 aa  64.7  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00658037  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1957  phosphodiesterase  27.41 
 
 
240 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1710  metallophosphoesterase  28.86 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0540724  normal  0.136885 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2463  metallophosphoesterase  30.95 
 
 
291 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11491  hypothetical protein  26.17 
 
 
271 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.112711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1957  CHAD domain containing protein  27.47 
 
 
681 aa  62.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1343  hypothetical protein  26.67 
 
 
271 aa  62  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  23.94 
 
 
239 aa  62  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0382  metallophosphoesterase  29.17 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_346  serine/threonine protein phosphatase  27.76 
 
 
297 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.4 
 
 
222 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4611  metallophosphoesterase  23.53 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5302  metallophosphoesterase  28.17 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8738  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15841  hypothetical protein  27.06 
 
 
296 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2290  metallophosphoesterase  27.56 
 
 
253 aa  60.1  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1019  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.82 
 
 
223 aa  59.7  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0273  metallophosphoesterase  29.76 
 
 
281 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0484  phosphodiesterase  25.28 
 
 
259 aa  59.7  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1656  metallophosphoesterase  28.27 
 
 
278 aa  59.3  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.865834  normal  0.107408 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.53 
 
 
227 aa  58.5  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0233  hypothetical protein  26.94 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1649  metallophosphoesterase  29.39 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.95 
 
 
219 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5408  metallophosphoesterase  28.72 
 
 
247 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1856  metallophosphoesterase  25.45 
 
 
252 aa  58.5  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.733001  normal  0.937707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4162  metallophosphoesterase  27 
 
 
243 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.159324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1877  metallophosphoesterase  30.93 
 
 
293 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.823338  normal  0.551763 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  28.19 
 
 
222 aa  56.2  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0140  putative serine/threonine protein phosphatase  28.5 
 
 
233 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3469  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.12 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2718  metallophosphoesterase  25.49 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09700  predicted phosphoesterase  31.38 
 
 
257 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1711  metallophosphoesterase  25.83 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.341536  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3758  metallophosphoesterase  27.67 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1757  hypothetical protein  27.78 
 
 
243 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3031  putative serine/threonine phosphatase  28.29 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4785  metallophosphoesterase  28.8 
 
 
216 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0413  metallophosphoesterase  25.12 
 
 
246 aa  52.8  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.636911  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1363  metallophosphoesterase  26.2 
 
 
240 aa  52  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0352046  hitchhiker  0.00042748 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  25.39 
 
 
184 aa  52  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2829  metallophosphoesterase  25.45 
 
 
304 aa  52  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.979042  normal  0.209971 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.11 
 
 
222 aa  52  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>