160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0856 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0856  metallophosphoesterase  100 
 
 		 246 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0272546  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3147  metallophosphoesterase  57.55 
 
 		 246 aa  292  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2883  metallophosphoesterase  57.14 
 
 		 246 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.134346 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3339  hypothetical protein  52.63 
 
 		 248 aa  251  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.201211  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0537  metallophosphoesterase  51.23 
 
 		 252 aa  252  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0093  hypothetical protein  51.43 
 
 		 246 aa  248  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0631  metallophosphoesterase  49.39 
 
 		 249 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0401  metallophosphoesterase  53.23 
 
 		 244 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5021  metallophosphoesterase  53.5 
 
 		 244 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.745206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1505  putative metallo-phosphoesterase  50.61 
 
 		 251 aa  231  6e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3115  metallophosphoesterase  53.09 
 
 		 244 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5252  metallophosphoesterase  53.09 
 
 		 244 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0201  metallophosphoesterase  49.61 
 
 		 264 aa  229  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0156  metallophosphoesterase  50.2 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3492  hypothetical protein  50.2 
 
 		 244 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.494136 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4612  metallophosphoesterase  53.91 
 
 		 244 aa  228  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5140  metallophosphoesterase  52.82 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1757  metallophosphoesterase  50.82 
 
 		 246 aa  221  8e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3461  metallophosphoesterase  52.42 
 
 		 244 aa  218  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2118  metallophosphoesterase  50.41 
 
 		 246 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1839  metallophosphoesterase  50 
 
 		 246 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3460  phosphoesterase  40.89 
 
 		 243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0392151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3469  metallophosphoesterase  41.3 
 
 		 243 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0139  metallophosphoesterase  46.92 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.18757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3589  metallophosphoesterase  48.59 
 
 		 247 aa  208  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.242712  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3480  metallophosphoesterase  40.89 
 
 		 243 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0474514  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4135  metallophosphoesterase  48.97 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0557704  hitchhiker  0.00370381 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0264  metallophosphoesterase  49.39 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.662192 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0673  hypothetical protein  46.99 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.293811  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3115  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.99 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.074661  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3674  metallophosphoesterase  43.09 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.373546  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4430  hypothetical protein  38.21 
 
 		 246 aa  158  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0870  metallophosphoesterase  34.57 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1879  metallophosphoesterase  32.68 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.16 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.57 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2886  metallophosphoesterase  30.74 
 
 		 268 aa  86.3  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.108757  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1782  metallophosphoesterase  33.62 
 
 		 235 aa  85.5  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.865967  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2771  metallophosphoesterase  32.31 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0273  metallophosphoesterase  31.95 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3845  metallophosphoesterase  26.94 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0619  metallophosphoesterase  31.06 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  27.41 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1568  hypothetical protein  31.48 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.65 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3084  metallophosphoesterase  27.78 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3127  metallophosphoesterase  28.22 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3469  serine/threonine protein phosphatase family protein  28.98 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4611  metallophosphoesterase  27.31 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4423  metallophosphoesterase  26.92 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1649  metallophosphoesterase  36.41 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1343  hypothetical protein  31.97 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  30 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0168  metallophosphoesterase  32.98 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15841  hypothetical protein  29.39 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.33 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4273  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  31.91 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.894943 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0656  metallophosphoesterase  31.36 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1656  metallophosphoesterase  31.69 
 
 		 278 aa  68.6  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.865834  normal  0.107408 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4162  metallophosphoesterase  28.23 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.159324 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0369  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.92 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0867019  normal  0.227919 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  26.25 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  26.25 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  27.83 
 
 		 636 aa  66.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  25.19 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1019  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.25 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2263  metallophosphoesterase  28.69 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.985376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2718  metallophosphoesterase  31.1 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0846  metallophosphoesterase  28.92 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.537551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1957  phosphodiesterase  30 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1174  metallophosphoesterase  33.19 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0750228  normal  0.054455 
 
 
-
 
NC_002936  DET0403  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.03 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3372  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.3 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11491  hypothetical protein  29.72 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.112711 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1877  metallophosphoesterase  31.25 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.823338  normal  0.551763 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1711  metallophosphoesterase  29.6 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.341536  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2813  metallophosphoesterase  32.99 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2829  metallophosphoesterase  28.62 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.979042  normal  0.209971 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2851  metallophosphoesterase  25.63 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00538078  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1737  metallophosphoesterase  28.3 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0484  phosphodiesterase  27.23 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1710  metallophosphoesterase  28.4 
 
 		 241 aa  62  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0540724  normal  0.136885 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.96 
 
 		 219 aa  62  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3490  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  29.07 
 
 		 251 aa  62  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0205997  normal  0.185531 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1856  metallophosphoesterase  26.87 
 
 		 252 aa  62  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.733001  normal  0.937707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5408  metallophosphoesterase  32.34 
 
 		 247 aa  62  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2789  serine/threonine protein phosphatase  24.79 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5302  metallophosphoesterase  28.63 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  31.48 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2182  phosphatase family protein  24.79 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.711182  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2829  serine/threonine protein phosphatase  24.79 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_346  serine/threonine protein phosphatase  30.13 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0808  metallophosphoesterase  27.1 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2857  phosphatase family protein  24.79 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3071  phosphatase family protein  24.79 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3080  phosphatase family protein  24.79 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3099  phosphatase family protein  25.1 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.261836  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0413  metallophosphoesterase  28.02 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.636911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4785  metallophosphoesterase  32.09 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1287  metallophosphoesterase  26 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000190987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>