More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1198 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1198  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 306 aa  637    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00512944  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 		 501 aa  70.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  29.05 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0454  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.22 
 
 		 368 aa  69.3  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  27.5 
 
 		 428 aa  69.3  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  26.14 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  27.11 
 
 		 397 aa  67  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2250  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.621052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2406  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  30.06 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  24.8 
 
 		 497 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0790  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.73 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  27.38 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.41 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  26.95 
 
 		 422 aa  62.8  0.000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2365  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  28.82 
 
 		 393 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2446  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.19 
 
 		 380 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121554  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  24.7 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  30.22 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.25 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.58 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  27.16 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  29.09 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2359  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.75 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  30.51 
 
 		 769 aa  59.7  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.83 
 
 		 394 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3419  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.35 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058581  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  23.39 
 
 		 468 aa  58.5  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.16 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.2 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1555  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.83 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0700995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1151  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.54 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00861011 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  27.44 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1375  Fe-S oxidoreductase-like  27.54 
 
 		 377 aa  57  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.771753  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  25.4 
 
 		 356 aa  57  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 		 377 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2893  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00746158  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  28.05 
 
 		 394 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  24.88 
 
 		 496 aa  57  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4009  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5988  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.51 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257809  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2703  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.41 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1978  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  21.11 
 
 		 372 aa  55.8  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.633092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  29.7 
 
 		 565 aa  55.8  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0169  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.57 
 
 		 375 aa  55.8  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280654  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 		 358 aa  55.8  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  27.22 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  25.88 
 
 		 336 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2033  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.47 
 
 		 395 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.39 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.79 
 
 		 337 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.82 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0274  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 		 337 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.481355  hitchhiker  0.000000283417 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4452  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1002  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 		 365 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4157  radical SAM superfamily protein  23.91 
 
 		 356 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41640  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.64 
 
 		 383 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.15 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5768  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.04 
 
 		 379 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  0.949586 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0790  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.86 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.134726  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  25.75 
 
 		 413 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.84 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1282  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.38 
 
 		 327 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.591085  normal  0.574415 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.63 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4827  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.38 
 
 		 382 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000395705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3748  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.247867  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.84 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  29.12 
 
 		 380 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1969  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.52 
 
 		 384 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.046264  normal  0.222604 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  22.97 
 
 		 491 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  25.47 
 
 		 330 aa  53.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  22.97 
 
 		 491 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  22.97 
 
 		 491 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0055  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.11 
 
 		 325 aa  53.5  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0195901 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  28.87 
 
 		 355 aa  53.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  22.97 
 
 		 491 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  30.12 
 
 		 382 aa  53.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0848  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.58 
 
 		 371 aa  53.5  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2952  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.57 
 
 		 340 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  20.83 
 
 		 373 aa  53.9  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 		 368 aa  53.5  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  22.97 
 
 		 491 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  22.97 
 
 		 491 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  26.37 
 
 		 415 aa  53.5  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.84 
 
 		 298 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3319  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.37 
 
 		 381 aa  53.1  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.328193 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  22.97 
 
 		 491 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1512  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.57 
 
 		 340 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  26.22 
 
 		 397 aa  52.8  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38780  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.31 
 
 		 381 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3305  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.31 
 
 		 370 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.92 
 
 		 308 aa  52.8  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>