26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1461 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1461  Fe-S oxidoreductase-like protein  100 
 
 
172 aa  360  8e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  33.11 
 
 
468 aa  83.6  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1844  Radical SAM domain protein  32.21 
 
 
453 aa  79.7  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  24.66 
 
 
459 aa  65.9  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 
378 aa  52.4  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  24.57 
 
 
491 aa  52.4  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  26.06 
 
 
349 aa  50.8  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  29.76 
 
 
346 aa  49.3  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  23.89 
 
 
501 aa  48.5  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 
380 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1154  radical SAM domain-containing protein  22.6 
 
 
377 aa  46.6  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.812273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  22.93 
 
 
376 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  22.78 
 
 
359 aa  45.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 
429 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  22.41 
 
 
428 aa  44.7  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  25.17 
 
 
438 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  23.36 
 
 
480 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  28.7 
 
 
384 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  22.73 
 
 
333 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 
389 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  22.47 
 
 
335 aa  43.5  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  21.29 
 
 
379 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 
377 aa  42.4  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1669  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.03 
 
 
321 aa  41.6  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.195157 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  24.36 
 
 
364 aa  40.8  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1680  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.38 
 
 
397 aa  41.2  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.725852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>