More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1302 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1302  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 321 aa  665    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1348  Radical SAM domain protein  72.98 
 
 		 322 aa  501  1e-141  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0737  Radical SAM domain protein  45.16 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  37.09 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  35.22 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  34.38 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  34.59 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1392  Radical SAM domain protein  35.17 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.358724 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  26.98 
 
 		 418 aa  72.4  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  25.98 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  33.97 
 
 		 401 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  33.97 
 
 		 401 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  33.97 
 
 		 401 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  29.52 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  29.86 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  32.91 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  27.2 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  33.97 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  32.69 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  30.32 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  32.52 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.8 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0775464  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  29.03 
 
 		 399 aa  67  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  29.93 
 
 		 422 aa  67  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1844  Radical SAM domain protein  25.86 
 
 		 453 aa  66.6  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115714  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  24.83 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2175  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  27.31 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  29.96 
 
 		 410 aa  66.2  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 		 350 aa  65.9  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  24.57 
 
 		 380 aa  65.9  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  31.65 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2492  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.98 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.250234  normal  0.0827229 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2098  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.98 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  28.75 
 
 		 496 aa  64.3  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  29.22 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  32.3 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2660  Fe-S oxidoreductase, putative coenzyme synthesis protein  25.53 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  33.12 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  32.03 
 
 		 495 aa  63.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  26.63 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  31.65 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  26.63 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2470  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.13 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616066 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6512  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.62 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.397453  normal  0.0847554 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1782  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.15 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.449437  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  30 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0401  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.26 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  31.68 
 
 		 393 aa  62.8  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0292  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.23 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.876947 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1805  radical SAM domain-containing protein  23.93 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.644596  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  28.74 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  25.12 
 
 		 561 aa  62.8  0.000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6304  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.16 
 
 		 398 aa  62.8  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 		 565 aa  62.4  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.72 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  27.7 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.94 
 
 		 373 aa  62  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  32.12 
 
 		 495 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1680  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.28 
 
 		 397 aa  62  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.74 
 
 		 414 aa  62  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0973479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.92 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  34.84 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3419  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.48 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058581  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0883  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.3 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  31.17 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  29.44 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0405  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.26 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  27.7 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.27 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  24.04 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0376  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.61 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  40.2 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.61 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1702  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.93 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.475579 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 574 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2366  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.09 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  32 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  25.21 
 
 		 487 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  30.26 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4674  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.68 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0509  coenzyme PQQ synthesis protein E  29.68 
 
 		 389 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  25.63 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  29.49 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  26.64 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  28.57 
 
 		 355 aa  59.3  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  29.49 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  23.38 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 		 381 aa  59.3  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  27.93 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  28.35 
 
 		 413 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  28.3 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  28.39 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2836  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.71 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  26.23 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>