More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1805 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1805  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 273 aa  556  1e-157  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.644596  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2016  Radical SAM domain protein  30.56 
 
 		 315 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0248343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2919  Fe-S oxidoreductases  29.09 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3033  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 		 322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2243  radical SAM domain-containing protein  30.98 
 
 		 313 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.787846  hitchhiker  0.00358781 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2579  radical SAM domain-containing protein  30.71 
 
 		 322 aa  102  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352944  normal  0.199519 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2165  Radical SAM domain protein  30.59 
 
 		 313 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0774157  hitchhiker  0.00100207 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1985  radical SAM domain-containing protein  29.66 
 
 		 314 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.757702  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 		 384 aa  67  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  30.77 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  24.38 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1302  radical SAM domain-containing protein  23.93 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  30.48 
 
 		 395 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 		 496 aa  62  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.74 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  27.72 
 
 		 396 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  27.59 
 
 		 358 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  29.22 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0737  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.68 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  23.32 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  30.25 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2206  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.16 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.915937  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  28.83 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  28.83 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  26.59 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  24.89 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  25.4 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  29.22 
 
 		 491 aa  60.1  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5563  radical SAM domain protein, putative  26.7 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.03073e-42 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  26.7 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  32.43 
 
 		 510 aa  58.9  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2732  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  27.82 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.107407  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  30.28 
 
 		 406 aa  58.9  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  24.39 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  30.28 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  27.33 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  27.14 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4674  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28 
 
 		 389 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8971  Radical SAM domain protein  25.16 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0893  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  33.33 
 
 		 208 aa  57  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0237925  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  25.73 
 
 		 353 aa  57  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  25.73 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0376  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.45 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  25.9 
 
 		 410 aa  57  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0405  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.45 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0401  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.67 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0509  coenzyme PQQ synthesis protein E  26.8 
 
 		 389 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1126  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  28.03 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0456  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  39.02 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.96 
 
 		 394 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2175  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  27.37 
 
 		 350 aa  55.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 418 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4827  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.81 
 
 		 382 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  26.55 
 
 		 608 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.27 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 		 396 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 330 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 		 497 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  23.22 
 
 		 399 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  29.51 
 
 		 487 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  26.94 
 
 		 401 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  27.16 
 
 		 579 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.91 
 
 		 399 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 		 337 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  24.76 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  26.7 
 
 		 414 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  26.94 
 
 		 401 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  28.93 
 
 		 401 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3571  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.43 
 
 		 325 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  24.76 
 
 		 380 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1175  radical SAM domain-containing protein  28.47 
 
 		 348 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.913807  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  26.94 
 
 		 401 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0965  putative ribonucleotide reductase activating transmembrane protein  26.56 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0426  Radical SAM domain protein  22.33 
 
 		 420 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  29.36 
 
 		 387 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  25.31 
 
 		 377 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1210  Radical SAM domain protein  27.56 
 
 		 529 aa  53.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2108  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25 
 
 		 237 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39710  putative radical-activating enzyme  23.68 
 
 		 232 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  26.23 
 
 		 399 aa  53.5  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00947  Molybdopterin cofactor biosynthetic proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13382]  29.22 
 
 		 694 aa  53.1  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  25.22 
 
 		 359 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  30.48 
 
 		 375 aa  53.1  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  26.58 
 
 		 397 aa  53.1  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  26.58 
 
 		 404 aa  53.1  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  24.07 
 
 		 480 aa  53.1  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4147  molybdenum cofactor synthesis-like  24.35 
 
 		 322 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  23.29 
 
 		 412 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  30.18 
 
 		 496 aa  52.4  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 		 398 aa  52.8  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  31.15 
 
 		 358 aa  52.4  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18280  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.58 
 
 		 231 aa  52.8  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.726853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  22.12 
 
 		 375 aa  52.4  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  22.71 
 
 		 383 aa  52.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3367  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase-activating protein  23.68 
 
 		 232 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.179526  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 		 501 aa  52  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>