157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3033 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3033  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 322 aa  673    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2243  radical SAM domain-containing protein  45.51 
 
 		 313 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.787846  hitchhiker  0.00358781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2165  Radical SAM domain protein  45.19 
 
 		 313 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0774157  hitchhiker  0.00100207 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1985  radical SAM domain-containing protein  46.55 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.757702  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2579  radical SAM domain-containing protein  42.21 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352944  normal  0.199519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2016  Radical SAM domain protein  32.76 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0248343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2919  Fe-S oxidoreductases  31.27 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1805  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.644596  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  33.59 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  27.57 
 
 		 415 aa  57  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.71 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  31.5 
 
 		 393 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  27.56 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  31.75 
 
 		 393 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2366  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.17 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  31.4 
 
 		 399 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  31.75 
 
 		 394 aa  53.1  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  27.64 
 
 		 396 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 		 366 aa  52.8  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  27.97 
 
 		 316 aa  52.8  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  25.85 
 
 		 413 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  32.28 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  32.23 
 
 		 407 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  29.11 
 
 		 395 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0881  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.74 
 
 		 329 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.659843  hitchhiker  0.00030609 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  29.55 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0486  hypothetical protein  26.97 
 
 		 375 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0401  YfkB-like domain-containing protein  26.97 
 
 		 375 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  26.72 
 
 		 391 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  30.58 
 
 		 390 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  27.43 
 
 		 337 aa  50.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  28.46 
 
 		 394 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.59 
 
 		 332 aa  49.7  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0444  Radical SAM domain protein  27.13 
 
 		 401 aa  49.3  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4837  hypothetical protein  26.4 
 
 		 375 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.768593  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0537  hypothetical protein  26.4 
 
 		 375 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0399  moaA/nifB/pqqE family protein  26.4 
 
 		 375 aa  49.3  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0395  moaA/nifB/pqqE family protein  26.4 
 
 		 375 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0467  hypothetical protein  26.4 
 
 		 375 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0537  hypothetical protein  26.4 
 
 		 375 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  30.86 
 
 		 484 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  27.31 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  29.48 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  27.97 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 		 384 aa  48.5  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  30.19 
 
 		 480 aa  48.9  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  25.59 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 389 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  28.38 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5047  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.08 
 
 		 353 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  29.03 
 
 		 348 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15625  predicted protein  33.33 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1348  Radical SAM domain protein  31.4 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  27.2 
 
 		 399 aa  47.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  24.89 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  23.59 
 
 		 361 aa  47.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50634  predicted protein  27.35 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.612985 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0407  YfkB-like domain-containing protein  25.84 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.81 
 
 		 351 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.136733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 		 434 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  29.27 
 
 		 410 aa  47.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  30.71 
 
 		 407 aa  47  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  27.97 
 
 		 323 aa  47.4  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  29.92 
 
 		 434 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0471  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.17 
 
 		 341 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.918131  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0821  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.31 
 
 		 337 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  26.4 
 
 		 390 aa  46.6  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  30.89 
 
 		 393 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  31.4 
 
 		 405 aa  47  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  26.8 
 
 		 431 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.72 
 
 		 371 aa  46.6  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1282  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.9 
 
 		 327 aa  46.6  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.591085  normal  0.574415 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1019  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.94 
 
 		 328 aa  46.6  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.33881  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0408  hypothetical protein  25.84 
 
 		 375 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0421  hypothetical protein  25.84 
 
 		 375 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.351837  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  28.46 
 
 		 404 aa  46.2  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  27.2 
 
 		 330 aa  46.2  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  25.93 
 
 		 422 aa  46.2  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  26.43 
 
 		 397 aa  46.2  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 334 aa  46.2  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  29.13 
 
 		 489 aa  46.2  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  23.87 
 
 		 303 aa  46.2  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  28.43 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.4 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.23 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.92 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.623593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  27.05 
 
 		 496 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0873  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.31 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1755  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.25 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.8 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  25.35 
 
 		 317 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2126  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.11 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.307772 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0869  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.31 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.18 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6304  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.87 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1931  YfkB-like domain-containing protein  26.6 
 
 		 383 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>