184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1985 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1985  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 314 aa  650    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.757702  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2243  radical SAM domain-containing protein  87.54 
 
 		 313 aa  564  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.787846  hitchhiker  0.00358781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2165  Radical SAM domain protein  86.9 
 
 		 313 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0774157  hitchhiker  0.00100207 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2579  radical SAM domain-containing protein  46.08 
 
 		 322 aa  272  5.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352944  normal  0.199519 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3033  radical SAM domain-containing protein  46.55 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2016  Radical SAM domain protein  32.53 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0248343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2919  Fe-S oxidoreductases  27.84 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1805  radical SAM domain-containing protein  29.66 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.644596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5563  radical SAM domain protein, putative  26.81 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.03073e-42 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.14 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1762  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.42 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.114768 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  29.69 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  30.59 
 
 		 332 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2195  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.89 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.823795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4961  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.38 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0712  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.31 
 
 		 367 aa  53.9  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1392  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.1 
 
 		 317 aa  53.1  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0056  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.69 
 
 		 348 aa  52.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0808361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  28.81 
 
 		 422 aa  52.8  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.29 
 
 		 344 aa  52.8  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  29.48 
 
 		 389 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2135  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.9 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  27.93 
 
 		 390 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2419  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.5 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.62 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2768  molybdopterin biosynthesis, protein A  27.78 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149516  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1755  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.01 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1930  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.81 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.16 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  25.2 
 
 		 394 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1202  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.67 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0471  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.23 
 
 		 341 aa  50.4  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.918131  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1410  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.29 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  23.71 
 
 		 414 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  29.31 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  29.27 
 
 		 384 aa  50.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0892  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.12 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.67 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  26.56 
 
 		 390 aa  49.7  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0873  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.21 
 
 		 337 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  36.56 
 
 		 474 aa  49.7  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  25.84 
 
 		 409 aa  49.7  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0869  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.21 
 
 		 337 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1392  Radical SAM domain protein  30.23 
 
 		 377 aa  49.3  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.358724 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0821  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.22 
 
 		 337 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  28.65 
 
 		 495 aa  49.3  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  25.82 
 
 		 338 aa  49.3  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0882  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.09 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  25.55 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0304  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.23 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2567  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.94 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 		 399 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  29.89 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0444  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 401 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  24.6 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.18 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.498315  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  30.08 
 
 		 393 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  31.39 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 366 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  22.62 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.71 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  30.51 
 
 		 399 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.24 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  27.51 
 
 		 397 aa  47.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.27 
 
 		 342 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.27 
 
 		 342 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0176  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.8 
 
 		 320 aa  47  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 391 aa  47  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0157  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.8 
 
 		 320 aa  47  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  25 
 
 		 387 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1282  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.23 
 
 		 327 aa  47  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.591085  normal  0.574415 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  33.33 
 
 		 479 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1905  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.64 
 
 		 329 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349909  unclonable  0.0000106016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0574  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.08 
 
 		 329 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 		 405 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0197  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.8 
 
 		 320 aa  46.6  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  26.97 
 
 		 396 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 378 aa  46.2  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  24.43 
 
 		 391 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15625  predicted protein  24.76 
 
 		 335 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0355  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.44 
 
 		 341 aa  46.2  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  30.4 
 
 		 393 aa  46.2  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3175  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.38 
 
 		 337 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4668  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26 
 
 		 326 aa  46.2  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0790  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.86 
 
 		 291 aa  46.2  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.134726  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  22.52 
 
 		 323 aa  45.8  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  26.61 
 
 		 345 aa  46.2  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3349  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.48 
 
 		 346 aa  45.8  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366452  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.99 
 
 		 308 aa  45.8  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4633  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.26 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0510268  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0611  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.2 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  28.33 
 
 		 399 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1941  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.67 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2095  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.73 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0221  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.45 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 		 429 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  27.37 
 
 		 406 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01630  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.5 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>