81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2165 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2165  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 313 aa  647    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0774157  hitchhiker  0.00100207 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2243  radical SAM domain-containing protein  99.36 
 
 		 313 aa  640    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.787846  hitchhiker  0.00358781 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1985  radical SAM domain-containing protein  86.9 
 
 		 314 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.757702  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3033  radical SAM domain-containing protein  45.19 
 
 		 322 aa  272  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2579  radical SAM domain-containing protein  44.97 
 
 		 322 aa  254  9e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352944  normal  0.199519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2016  Radical SAM domain protein  31.62 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0248343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2919  Fe-S oxidoreductases  28.87 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1805  radical SAM domain-containing protein  30.59 
 
 		 273 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.644596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5563  radical SAM domain protein, putative  28 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.03073e-42 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1392  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.29 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 		 394 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  28.16 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0611  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.4 
 
 		 369 aa  49.7  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  27.53 
 
 		 330 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  24.87 
 
 		 414 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.17 
 
 		 371 aa  49.3  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  24.63 
 
 		 360 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  23.62 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  27.81 
 
 		 393 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  27.64 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 		 399 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0712  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.88 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  27.05 
 
 		 390 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1755  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.22 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.36 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1762  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.06 
 
 		 333 aa  47  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.114768 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.85 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1941  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.56 
 
 		 333 aa  46.6  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1282  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.51 
 
 		 327 aa  46.2  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.591085  normal  0.574415 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  25.99 
 
 		 330 aa  46.2  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 398 aa  46.2  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.43 
 
 		 308 aa  45.8  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  26.44 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  25.89 
 
 		 397 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10886  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.67 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6033000000000002e-27  normal  0.157958 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 		 366 aa  45.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1905  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.2 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349909  unclonable  0.0000106016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2419  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.36 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2135  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.89 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.37 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.64 
 
 		 384 aa  44.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2247  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.49 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4633  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.88 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0510268  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2025  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.56 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0221  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.99 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  22.65 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  23.5 
 
 		 405 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.76 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1930  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.29 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  27.05 
 
 		 401 aa  43.5  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  34.41 
 
 		 474 aa  43.9  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 		 393 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 		 303 aa  43.9  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 		 378 aa  43.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  24.56 
 
 		 347 aa  43.5  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  23.11 
 
 		 496 aa  43.1  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  26.77 
 
 		 327 aa  43.1  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  25.25 
 
 		 323 aa  43.1  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  25.12 
 
 		 363 aa  43.1  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 396 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  31.18 
 
 		 479 aa  43.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 		 323 aa  43.1  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  25.58 
 
 		 391 aa  42.7  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.22 
 
 		 329 aa  43.1  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  28.57 
 
 		 495 aa  42.7  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1434  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.75 
 
 		 326 aa  42.7  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  30.69 
 
 		 325 aa  42.7  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  29.37 
 
 		 501 aa  42.7  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  27.05 
 
 		 317 aa  42.7  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 400 aa  42.7  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  22.66 
 
 		 334 aa  42.7  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2836  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.75 
 
 		 326 aa  42.7  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2922  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.75 
 
 		 326 aa  42.7  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.347624  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1582  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  21.49 
 
 		 349 aa  42.7  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.519622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15625  predicted protein  21.93 
 
 		 335 aa  42.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  26.37 
 
 		 338 aa  42.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2195  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.38 
 
 		 333 aa  42.4  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.823795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.18 
 
 		 332 aa  42.4  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  23.95 
 
 		 459 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>