110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2579 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2579  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 322 aa  666    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352944  normal  0.199519 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1985  radical SAM domain-containing protein  46.08 
 
 		 314 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.757702  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2243  radical SAM domain-containing protein  45.3 
 
 		 313 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.787846  hitchhiker  0.00358781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2165  Radical SAM domain protein  44.97 
 
 		 313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0774157  hitchhiker  0.00100207 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3033  radical SAM domain-containing protein  42.21 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2016  Radical SAM domain protein  32.35 
 
 		 315 aa  153  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0248343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2919  Fe-S oxidoreductases  30 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1805  radical SAM domain-containing protein  30.71 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.644596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  23.97 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  26.19 
 
 		 350 aa  52.8  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 480 aa  52.8  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  23.46 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  23.56 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5563  radical SAM domain protein, putative  23.47 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.03073e-42 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 431 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7439  Fe-S oxidoreductase-like protein  25.13 
 
 		 360 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 323 aa  50.1  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 		 400 aa  50.1  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  24.03 
 
 		 487 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  25 
 
 		 422 aa  49.7  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 		 454 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  24 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 		 389 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.83 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  35.05 
 
 		 418 aa  48.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  27.22 
 
 		 513 aa  47.8  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  23.44 
 
 		 454 aa  47.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  24.02 
 
 		 316 aa  47.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  32.38 
 
 		 496 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  23.41 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  23.44 
 
 		 454 aa  47.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  23.77 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0891  hypothetical protein  24.49 
 
 		 344 aa  47  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.416371  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  27.69 
 
 		 332 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 		 399 aa  47  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 		 442 aa  46.6  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  23.2 
 
 		 460 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  29.05 
 
 		 327 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  22.58 
 
 		 380 aa  46.2  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  27.91 
 
 		 438 aa  46.2  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  25.28 
 
 		 382 aa  46.2  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1604  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.94 
 
 		 328 aa  46.2  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  20.47 
 
 		 394 aa  46.2  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  25.76 
 
 		 365 aa  45.4  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  25.38 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  36.84 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 		 403 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1392  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.358724 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  36.9 
 
 		 378 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  24.86 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4147  molybdenum cofactor synthesis-like  23.53 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1706  radical SAM domain-containing protein  26.22 
 
 		 516 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  23.41 
 
 		 405 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.87 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.82 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  27.48 
 
 		 449 aa  45.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1392  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.88 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  23.87 
 
 		 496 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  26.4 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1275  Radical SAM domain protein  23.75 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  20.91 
 
 		 397 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0901  Radical SAM domain protein  24.18 
 
 		 414 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.912701 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1639  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  23.65 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.687552  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  21.43 
 
 		 384 aa  43.9  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1535  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  23.15 
 
 		 322 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.495642 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  27.81 
 
 		 489 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  29.14 
 
 		 468 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  28.46 
 
 		 396 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  22.37 
 
 		 394 aa  43.9  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0376  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  38.03 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00708242  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 		 472 aa  43.9  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  28.23 
 
 		 393 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3594  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.03 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.03 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0726  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.56 
 
 		 324 aa  43.5  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130382 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3584  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3277  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.03 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.589823  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  22.92 
 
 		 387 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3363  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.03 
 
 		 338 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3627  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.03 
 
 		 338 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0221  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.37 
 
 		 322 aa  43.1  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3791  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  23.76 
 
 		 322 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0673819 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2836  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.39 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  29.37 
 
 		 395 aa  43.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1434  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.39 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2922  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.39 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.347624  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  25.55 
 
 		 484 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  23.76 
 
 		 335 aa  42.7  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2135  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.71 
 
 		 323 aa  43.1  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0444  Radical SAM domain protein  22.41 
 
 		 401 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  22.92 
 
 		 387 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  38.89 
 
 		 463 aa  42.7  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  27.65 
 
 		 368 aa  42.7  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  28.85 
 
 		 561 aa  42.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>