More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1639 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1639  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  100 
 
 
322 aa  652    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.687552  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4147  molybdenum cofactor synthesis-like  86.02 
 
 
322 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115526  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1500  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  83.54 
 
 
322 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1969  molybdenum cofactor biosynthesis protein A, putative  83.54 
 
 
337 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3791  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  83.54 
 
 
322 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0673819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1535  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  81.68 
 
 
322 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.495642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2482  molybdenum cofactor biosynthesis protein A, putative  67.7 
 
 
322 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625528  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35520  Molybdenum cofactor biosynthesis protein  60.37 
 
 
287 aa  332  7.000000000000001e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785405  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  40.99 
 
 
317 aa  231  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1655  molybdenum cofactor synthesis-like protein  38.49 
 
 
337 aa  183  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.5 
 
 
344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292381  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2254  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.56 
 
 
344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.0526989 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2247  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.77 
 
 
348 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.72 
 
 
345 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2293  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.63 
 
 
340 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2335  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.63 
 
 
340 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.228355  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.79 
 
 
344 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.460525 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2025  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.33 
 
 
348 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930422  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2266  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.14 
 
 
329 aa  176  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00162832  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1785  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.17 
 
 
351 aa  176  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1878  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.65 
 
 
355 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0061453  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1156  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.63 
 
 
322 aa  175  8e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.07 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2774  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.18 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00282433  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0822  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.04 
 
 
322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0225831  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0235  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.3 
 
 
344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.84 
 
 
328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0304  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.83 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.14 
 
 
339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187872  normal  0.347401 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2650  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.18 
 
 
344 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.35 
 
 
326 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.49 
 
 
340 aa  172  9e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1290  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.48 
 
 
336 aa  172  9e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0333256  normal  0.347849 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.54 
 
 
333 aa  171  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2877  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.82 
 
 
344 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.593908  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.61 
 
 
332 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.412863  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.91 
 
 
342 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.91 
 
 
342 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3287  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.48 
 
 
345 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_004310  BR0958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.3 
 
 
344 aa  170  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.105392  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3349  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.61 
 
 
346 aa  170  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366452  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.84 
 
 
329 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1832  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.55 
 
 
380 aa  170  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1477  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.84 
 
 
343 aa  169  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0591  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.62 
 
 
328 aa  169  6e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2052  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.16 
 
 
344 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.77 
 
 
335 aa  169  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.485207  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19300  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  37.5 
 
 
333 aa  169  8e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00282794  normal  0.0296768 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.28 
 
 
344 aa  169  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0948  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.94 
 
 
344 aa  168  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2191  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.89 
 
 
344 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1219  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.23 
 
 
343 aa  168  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4457  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.01 
 
 
339 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.65 
 
 
327 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1239  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.05 
 
 
329 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0221  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.94 
 
 
322 aa  167  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02449  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.3 
 
 
343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1999  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis C-terminal  35.02 
 
 
357 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655025  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.56 
 
 
356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0260  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.53 
 
 
331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.27 
 
 
321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1582  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.97 
 
 
349 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.519622  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.38 
 
 
335 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4867  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.63 
 
 
334 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4475  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.67 
 
 
337 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6712  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.43 
 
 
346 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420701  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6965  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  39.02 
 
 
374 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.05 
 
 
329 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  0.121323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2577  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis C-terminal  38.43 
 
 
323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.646455  normal  0.38451 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7063  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.58 
 
 
374 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00651561  normal  0.935573 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4861  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.81 
 
 
337 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1425  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.58 
 
 
374 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1426  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.9 
 
 
322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6404  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.58 
 
 
374 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.75 
 
 
328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4837  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.16 
 
 
337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.979257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4843  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.67 
 
 
337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0399  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.67 
 
 
337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245923  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1558  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.3 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0892  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.96 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2272  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.5 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2294  molybdenum cofactor synthesis-like protein  32.48 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.819438  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.2 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.4 
 
 
345 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.13 
 
 
326 aa  163  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3397  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.37 
 
 
337 aa  163  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0159  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.55 
 
 
322 aa  163  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000610838  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1853  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.86 
 
 
335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0143  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.49 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.391723 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2419  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.36 
 
 
326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2160  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.93 
 
 
322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1520  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  36.13 
 
 
346 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.886892 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  35.97 
 
 
327 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.66 
 
 
328 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0460197  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0925  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  34.29 
 
 
339 aa  162  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4099  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.18 
 
 
328 aa  162  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1387  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.69 
 
 
351 aa  162  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1605  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.25 
 
 
331 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3571  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.04 
 
 
325 aa  162  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.14 
 
 
337 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.321552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>