More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2016 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2016  Radical SAM domain protein  100 
 
 
315 aa  641    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0248343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2919  Fe-S oxidoreductases  43.46 
 
 
293 aa  216  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2579  radical SAM domain-containing protein  33.01 
 
 
322 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352944  normal  0.199519 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3033  radical SAM domain-containing protein  32.42 
 
 
322 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1985  radical SAM domain-containing protein  32.53 
 
 
314 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.757702  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2243  radical SAM domain-containing protein  31.96 
 
 
313 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.787846  hitchhiker  0.00358781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2165  Radical SAM domain protein  31.62 
 
 
313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0774157  hitchhiker  0.00100207 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1805  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 
273 aa  125  9e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.644596  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  27.75 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  28.78 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  30.45 
 
 
479 aa  70.1  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 
427 aa  69.3  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  22.6 
 
 
358 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 
349 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  24.66 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  27.62 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  24.22 
 
 
450 aa  67.4  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  28.96 
 
 
399 aa  67  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  29.3 
 
 
370 aa  67  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  28.18 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  28.11 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  28.1 
 
 
332 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  28.83 
 
 
332 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  35.09 
 
 
406 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  35.09 
 
 
406 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 
380 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2651  Radical SAM domain protein  30.86 
 
 
415 aa  64.7  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.135076 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  27.18 
 
 
480 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.03 
 
 
321 aa  64.3  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.08 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  27.84 
 
 
453 aa  63.9  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2366  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.88 
 
 
332 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1506  Radical SAM domain protein  36.49 
 
 
333 aa  63.9  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 
333 aa  63.5  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.65 
 
 
325 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0260  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.43 
 
 
331 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  29.25 
 
 
335 aa  62.8  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.98 
 
 
389 aa  62.4  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 
407 aa  61.6  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 
391 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  27.98 
 
 
377 aa  62  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.71 
 
 
333 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 
354 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  24 
 
 
422 aa  61.2  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0873  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.26 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  22.6 
 
 
356 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  29.76 
 
 
387 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0869  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.26 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  30.95 
 
 
387 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  28.17 
 
 
391 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  27.94 
 
 
382 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 
404 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1348  Radical SAM domain protein  30.19 
 
 
322 aa  60.8  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  27.4 
 
 
334 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  25.93 
 
 
399 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  28.77 
 
 
338 aa  60.8  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  24.04 
 
 
358 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1339  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.48 
 
 
326 aa  60.5  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3594  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.89 
 
 
338 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 
393 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.91 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3584  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.89 
 
 
338 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.89 
 
 
338 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.89 
 
 
338 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00708242  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3277  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.89 
 
 
338 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.589823  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 
378 aa  60.1  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1535  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  31.33 
 
 
322 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.495642 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  27.94 
 
 
462 aa  60.1  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  22.12 
 
 
356 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3677  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.89 
 
 
338 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1640  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.89 
 
 
338 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 
368 aa  59.3  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3363  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.33 
 
 
338 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3627  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.33 
 
 
338 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13126  molybdenum cofactor biosynthesis protein A moaA1  25.11 
 
 
359 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0851136 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  24.24 
 
 
292 aa  58.9  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.92 
 
 
317 aa  59.3  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  25.73 
 
 
365 aa  59.3  0.00000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1500  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  26.5 
 
 
322 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3791  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  31.79 
 
 
322 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0673819 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  29.85 
 
 
460 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.37 
 
 
397 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0821  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.72 
 
 
337 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  20.67 
 
 
357 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  27.11 
 
 
399 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0894  radical SAM domain-containing protein  31.94 
 
 
320 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.192099  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2214  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.15 
 
 
363 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.422159  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  23.55 
 
 
361 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  30.77 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  30.1 
 
 
369 aa  57.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2766  radical SAM family Fe-S protein  28.14 
 
 
340 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1465  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.39 
 
 
292 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  30.23 
 
 
366 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1639  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  31.01 
 
 
322 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.687552  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  30.3 
 
 
397 aa  57.4  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4147  molybdenum cofactor synthesis-like  27.86 
 
 
322 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115526  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  27.16 
 
 
402 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>