More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2919 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2919  Fe-S oxidoreductases  100 
 
 		 293 aa  608  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2016  Radical SAM domain protein  43.46 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0248343  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3033  radical SAM domain-containing protein  31.27 
 
 		 322 aa  125  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2579  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352944  normal  0.199519 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1805  radical SAM domain-containing protein  29.09 
 
 		 273 aa  117  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.644596  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2243  radical SAM domain-containing protein  29.55 
 
 		 313 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.787846  hitchhiker  0.00358781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2165  Radical SAM domain protein  28.87 
 
 		 313 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0774157  hitchhiker  0.00100207 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1985  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.757702  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  38.38 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  28.22 
 
 		 391 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0894  radical SAM domain-containing protein  27.45 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.192099  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  29.76 
 
 		 445 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  28.14 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  31.89 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  30.41 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  31.25 
 
 		 479 aa  66.2  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2470  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.91 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616066 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1392  Radical SAM domain protein  36.36 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.358724 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  26.06 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1680  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.5 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  26.54 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5563  radical SAM domain protein, putative  22.73 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.03073e-42 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  31.82 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  28.5 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  31.11 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  31.06 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  24.79 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  24.4 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  26.55 
 
 		 406 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 		 406 aa  62.4  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  27.66 
 
 		 496 aa  61.6  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4990  radical SAM family protein  39.29 
 
 		 386 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.396764  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  24.84 
 
 		 427 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  27.12 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  25.87 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  28.14 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  25.86 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  31 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  28.04 
 
 		 465 aa  60.1  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.56 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.150744  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  26.29 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  28.39 
 
 		 390 aa  59.3  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  31.82 
 
 		 338 aa  58.9  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0710  Radical SAM domain protein  37.04 
 
 		 388 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0683  Radical SAM domain protein  37.04 
 
 		 388 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  30.19 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  29.25 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  31.9 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4038  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.29 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0608  coenzyme PQQ synthesis protein E  34.69 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.051547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2766  radical SAM family Fe-S protein  33 
 
 		 340 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  28.91 
 
 		 348 aa  57  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4663  Radical SAM domain protein  32.22 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0193587 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 497 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.1 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.72 
 
 		 399 aa  55.8  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.33 
 
 		 394 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6304  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.32 
 
 		 398 aa  55.8  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.87 
 
 		 380 aa  55.8  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5965  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.29 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0233125 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  24.29 
 
 		 390 aa  55.5  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  27.65 
 
 		 450 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1348  Radical SAM domain protein  25.44 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  23.46 
 
 		 402 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1817  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.15 
 
 		 384 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  26.27 
 
 		 382 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2153  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.15 
 
 		 384 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.666004  normal  0.11423 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0737  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3061  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  32.14 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  25.89 
 
 		 460 aa  55.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  25.81 
 
 		 450 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  27.94 
 
 		 399 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  24.05 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  28.09 
 
 		 380 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  26.28 
 
 		 366 aa  55.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1302  radical SAM domain-containing protein  22.55 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1968  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 		 458 aa  54.3  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.92 
 
 		 397 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  28.57 
 
 		 369 aa  54.3  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1769  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.15 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  26.89 
 
 		 359 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 		 446 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 		 438 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  26.88 
 
 		 365 aa  54.7  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  23.7 
 
 		 394 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.14 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0509  coenzyme PQQ synthesis protein E  23.86 
 
 		 389 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1978  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.45 
 
 		 372 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.633092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  24.14 
 
 		 399 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  29.82 
 
 		 373 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2446  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.99 
 
 		 380 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121554  normal  0.0228236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>