264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0182 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  100 
 
 		 369 aa  769    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1064  radical SAM domain-containing protein  49.73 
 
 		 365 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.468822  normal  0.968223 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01021  hypothetical protein  47.72 
 
 		 373 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.816192 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1586  radical SAM family protein  35.97 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0177  radical SAM family protein  27.94 
 
 		 372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.698116  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2164  radical SAM domain-containing protein  24.63 
 
 		 349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.295283  normal  0.13164 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1057  radical SAM domain-containing protein  24 
 
 		 354 aa  116  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01061  hypothetical protein  26.65 
 
 		 387 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.392097 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1592  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 354 aa  100  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  26.49 
 
 		 574 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1593  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 		 354 aa  88.6  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2900  Radical SAM domain protein  27.72 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  24.4 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.33 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  23.25 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0414  radical SAM domain protein  27.92 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00760718  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0894  radical SAM domain-containing protein  21.96 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.192099  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3252  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.68 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  24.88 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  22.09 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  22.09 
 
 		 778 aa  59.3  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  21.43 
 
 		 351 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  23.11 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  19.71 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  23.5 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  24.55 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2016  Radical SAM domain protein  30.1 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0248343  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  22.66 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  24.79 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  22.26 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  21.11 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.03 
 
 		 332 aa  57  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  23.37 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0574  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.47 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  27.4 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4038  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.22 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0608  coenzyme PQQ synthesis protein E  23.57 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.051547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4636  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.38 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.886465  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1831  radical SAM domain-containing protein  22.64 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  22.46 
 
 		 515 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  21.45 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2919  Fe-S oxidoreductases  28.57 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  24.45 
 
 		 361 aa  53.9  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3162  radical SAM domain-containing protein  20.86 
 
 		 351 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.313662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1849  Radical SAM domain protein  24.53 
 
 		 310 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  23.13 
 
 		 341 aa  53.5  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0576  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 		 457 aa  53.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.11056  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.07 
 
 		 317 aa  53.1  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  26.26 
 
 		 316 aa  53.1  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  23.24 
 
 		 782 aa  53.1  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.9 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.9 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1356  radical SAM superfamily protein  26.15 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0234183  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3245  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  23.93 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1006  tRNA-modifying enzyme  26.58 
 
 		 345 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  22.12 
 
 		 313 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0260  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.87 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  27.37 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4867  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.08 
 
 		 334 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  21.36 
 
 		 366 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4556  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.45 
 
 		 337 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4837  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.58 
 
 		 337 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.979257  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4861  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.08 
 
 		 337 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  21.88 
 
 		 327 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4622  molybdenum cofactor biosynthesis protein A, N-terminus  30.08 
 
 		 252 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4457  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.08 
 
 		 339 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4475  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.08 
 
 		 337 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4843  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.08 
 
 		 337 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.87 
 
 		 298 aa  50.8  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0399  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.83 
 
 		 337 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0869  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.11 
 
 		 337 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0821  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.11 
 
 		 337 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  23.77 
 
 		 331 aa  50.4  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0873  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.11 
 
 		 337 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  21.24 
 
 		 338 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2567  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.53 
 
 		 333 aa  50.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1300  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 		 457 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.32123  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0795  Radical SAM domain protein  33.71 
 
 		 296 aa  50.1  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1348  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.41 
 
 		 329 aa  50.1  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  21.43 
 
 		 328 aa  50.1  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1392  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.45 
 
 		 317 aa  50.1  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  23.2 
 
 		 347 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1371  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 		 457 aa  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000145601 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  28.68 
 
 		 326 aa  49.7  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4961  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.27 
 
 		 326 aa  49.7  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3397  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.83 
 
 		 337 aa  49.7  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1002  Radical SAM domain protein  22.56 
 
 		 365 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3061  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  35 
 
 		 326 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1506  Radical SAM domain protein  21.97 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1770  radical SAM domain-containing protein  27.37 
 
 		 287 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.201175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8972  Radical SAM domain protein  22.3 
 
 		 364 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1705  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.27 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.986754 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  25.16 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.420776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>