More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7439 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7439  Fe-S oxidoreductase-like protein  100 
 
 		 360 aa  733    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  33.9 
 
 		 405 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  34.64 
 
 		 391 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  34.64 
 
 		 396 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  35.2 
 
 		 401 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  35.2 
 
 		 401 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  35.2 
 
 		 401 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  35.09 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  34.3 
 
 		 409 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  32.96 
 
 		 429 aa  91.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  35.5 
 
 		 367 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  33.92 
 
 		 396 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  32.95 
 
 		 474 aa  89.4  8e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  24.61 
 
 		 327 aa  89.4  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  32.4 
 
 		 410 aa  89.4  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  37.06 
 
 		 412 aa  89.4  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  31.98 
 
 		 380 aa  88.6  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  37.88 
 
 		 482 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  33.79 
 
 		 349 aa  85.9  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  30.65 
 
 		 491 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  31.03 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  36.36 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  29.53 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  32.2 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  34.85 
 
 		 487 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  34.85 
 
 		 491 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  34.85 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  34.85 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  34.85 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  34.85 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  34.85 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  34.85 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  29.34 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  37.68 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  31.18 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  23.19 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  30.41 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 333 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  31.54 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  34.09 
 
 		 491 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  25.4 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  25.58 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  26.27 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  22.29 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  27.7 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  34.85 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  27.19 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  33.09 
 
 		 510 aa  77  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  28.05 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  29.35 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  27.7 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  27.7 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  30.88 
 
 		 399 aa  76.3  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 		 459 aa  76.3  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  31.62 
 
 		 479 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  30.34 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  29.52 
 
 		 347 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  27.7 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  30.08 
 
 		 496 aa  75.5  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  36.36 
 
 		 383 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  32.82 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  35.07 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  31.25 
 
 		 480 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  27.51 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  34.09 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  25.66 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 501 aa  74.7  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  24.28 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  36.3 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  28.36 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  31.65 
 
 		 404 aa  72.8  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  32.35 
 
 		 364 aa  72.8  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  27.73 
 
 		 386 aa  72.8  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  32.87 
 
 		 380 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 565 aa  72  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 405 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  30.99 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  32.64 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  30.2 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  29.08 
 
 		 350 aa  72  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  21.69 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  35.04 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  32.62 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  25.29 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  24.75 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  35.04 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  29.1 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  35.61 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  21.84 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  31.34 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  31.11 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>