More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0825 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  100 
 
 
384 aa  805    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  35.83 
 
 
372 aa  250  3e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  34.37 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  26.59 
 
 
340 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  30.35 
 
 
434 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  25.55 
 
 
367 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 
446 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 
355 aa  97.4  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  23.96 
 
 
340 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  25.52 
 
 
351 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 
351 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  27.75 
 
 
450 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  24.67 
 
 
390 aa  91.3  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  23.17 
 
 
471 aa  89.4  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  22.7 
 
 
421 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  26.06 
 
 
301 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 
446 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  22.4 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 
474 aa  87  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  27.67 
 
 
445 aa  86.7  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  23.32 
 
 
341 aa  86.3  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  33.07 
 
 
465 aa  86.3  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  26.44 
 
 
437 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  24.69 
 
 
451 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  28.92 
 
 
445 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3051  Radical SAM domain protein  25.62 
 
 
461 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.684834  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  24.1 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  23.75 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0369  radical SAM domain-containing protein  23.1 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.722387  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  22.26 
 
 
323 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  23.34 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  23.24 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  24 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0433  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 
433 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  20.73 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  22.08 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  21.46 
 
 
447 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 
515 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  22.49 
 
 
427 aa  70.1  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  22.45 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  20.7 
 
 
428 aa  69.7  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3016  radical SAM domain-containing protein  28.12 
 
 
513 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  21.65 
 
 
332 aa  69.3  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2991  Radical SAM domain protein  24.6 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  28.26 
 
 
480 aa  68.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  22.44 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1943  Radical SAM domain protein  32.06 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.227047  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0802  radical SAM domain-containing protein  23.2 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  22.47 
 
 
574 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  20.92 
 
 
367 aa  67  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  23.89 
 
 
349 aa  67  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  21.9 
 
 
325 aa  67  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3080  Radical SAM domain protein  22.57 
 
 
351 aa  66.6  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  34.17 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2577  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 
371 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.014973  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  20.16 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  22.63 
 
 
333 aa  66.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  23.05 
 
 
391 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  29.94 
 
 
341 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  20.56 
 
 
380 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  25.88 
 
 
367 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  22.88 
 
 
365 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1586  radical SAM family protein  22.98 
 
 
356 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 
338 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  22.46 
 
 
358 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  26.97 
 
 
873 aa  63.9  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  25.12 
 
 
345 aa  63.5  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  24.61 
 
 
453 aa  63.2  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  23.96 
 
 
347 aa  63.2  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.19 
 
 
317 aa  63.2  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  20.55 
 
 
327 aa  62.8  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  21.82 
 
 
376 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  27.08 
 
 
354 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  20.36 
 
 
366 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  21.49 
 
 
358 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  21.15 
 
 
344 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  22.44 
 
 
375 aa  61.6  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 
496 aa  62  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  20.16 
 
 
387 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  20.6 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  22.46 
 
 
401 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  22.46 
 
 
401 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 
395 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  21.51 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2164  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 
349 aa  62  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.295283  normal  0.13164 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1786  Radical SAM domain protein  20.96 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  22.46 
 
 
401 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  21.86 
 
 
358 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  20.62 
 
 
330 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  25.76 
 
 
359 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  27.37 
 
 
368 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  24.42 
 
 
319 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  23.43 
 
 
411 aa  60.8  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  27.13 
 
 
565 aa  60.8  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  27.32 
 
 
355 aa  60.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1064  radical SAM domain-containing protein  24.63 
 
 
365 aa  60.5  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.468822  normal  0.968223 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0419  Fe-S oxidoreductase-like protein  29.17 
 
 
284 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.399377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>