More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0368 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 574 aa  1177    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  26.49 
 
 		 369 aa  99  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1064  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 		 365 aa  87.8  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.468822  normal  0.968223 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1586  radical SAM family protein  26.63 
 
 		 356 aa  86.7  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  24.64 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  32.07 
 
 		 565 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  30.84 
 
 		 468 aa  79.3  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1592  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  24.2 
 
 		 501 aa  77  0.0000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1057  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 		 354 aa  76.6  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  26.91 
 
 		 316 aa  75.9  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1593  radical SAM domain-containing protein  24.65 
 
 		 354 aa  75.9  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0366  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.66 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592907  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01021  hypothetical protein  21.98 
 
 		 373 aa  73.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.816192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1973  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.03 
 
 		 242 aa  73.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  27.05 
 
 		 337 aa  72  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 323 aa  72  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0177  radical SAM family protein  21.22 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.698116  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  28.26 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1348  Radical SAM domain protein  25.85 
 
 		 322 aa  70.1  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  31.84 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 459 aa  69.3  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  31.84 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  28.27 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  22.47 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1893  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.23 
 
 		 231 aa  67  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  24.35 
 
 		 365 aa  67  0.0000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0608  coenzyme PQQ synthesis protein E  22.77 
 
 		 330 aa  66.6  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.051547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2634  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.27 
 
 		 227 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  25.99 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1198  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.46 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1320  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.79 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1966  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.21 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.333673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 		 497 aa  63.5  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00748  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.69 
 
 		 329 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2861  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.69 
 
 		 329 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.228383  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 396 aa  63.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0929  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.69 
 
 		 329 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2862  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.69 
 
 		 340 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0111085  normal  0.0131262 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1375  Fe-S oxidoreductase-like  23.58 
 
 		 377 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.771753  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.69 
 
 		 329 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0835  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.69 
 
 		 329 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.344402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0844  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.69 
 
 		 329 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0987442  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2571  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.69 
 
 		 329 aa  63.2  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 		 347 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00765  hypothetical protein  30.69 
 
 		 329 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  28.17 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  23.3 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2766  radical SAM family Fe-S protein  24.92 
 
 		 340 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  29.3 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  23.42 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  26.73 
 
 		 391 aa  62  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  30.71 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  24.64 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0201  hypothetical protein  24.17 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  25.45 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  24.85 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1951  radical SAM family Fe-S protein  23.69 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  23.93 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3732  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.98 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1302  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0928  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.98 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  27.8 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2836  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.99 
 
 		 326 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0837  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.98 
 
 		 329 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 		 340 aa  59.7  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0378398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0896  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.98 
 
 		 329 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2435  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.65 
 
 		 340 aa  60.1  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.168492  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  26.1 
 
 		 373 aa  60.1  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2922  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.99 
 
 		 326 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.347624  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.98 
 
 		 329 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0865  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.98 
 
 		 329 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  27.8 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  24.49 
 
 		 491 aa  59.7  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1434  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.99 
 
 		 326 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  24.6 
 
 		 438 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  27.8 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4674  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.73 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1512  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.5 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.54 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0195  radical SAM family protein  24.83 
 
 		 342 aa  59.3  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0369  radical SAM domain-containing protein  23.61 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.722387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0509  coenzyme PQQ synthesis protein E  24.59 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  28.38 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  23.03 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  23.39 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  26.24 
 
 		 474 aa  58.2  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  30.82 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  24.4 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2952  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0829  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0135  acylneuraminate cytidylyltransferase  21.22 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000000052261 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1031  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.02 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0616  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.25 
 
 		 611 aa  57.4  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0678473 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  30.05 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  26.98 
 
 		 399 aa  56.6  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  25.64 
 
 		 479 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>