More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1266 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1266  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 571 aa  1187    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753017 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0956  Radical SAM domain protein  56.49 
 
 		 532 aa  554  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000891035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0890  radical SAM domain-containing protein  44.31 
 
 		 537 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2458  radical SAM domain-containing protein  41.65 
 
 		 536 aa  435  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1560  radical SAM domain-containing protein  49.02 
 
 		 412 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0307632  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2541  Radical SAM domain protein  44.58 
 
 		 498 aa  385  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0787  Radical SAM domain protein  42.59 
 
 		 537 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0612604  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1210  Radical SAM domain protein  42.8 
 
 		 529 aa  382  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1309  radical SAM family protein  28.81 
 
 		 357 aa  128  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18370  predicted Fe-S oxidoreductase  27.25 
 
 		 384 aa  127  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2641  Radical SAM domain protein  27.7 
 
 		 358 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.587199  normal  0.0478342 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1710  Radical SAM domain protein  29.5 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00399372  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  26.82 
 
 		 319 aa  100  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  25.65 
 
 		 496 aa  98.6  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 		 347 aa  94.4  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  26.75 
 
 		 378 aa  93.2  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  26.96 
 
 		 377 aa  92.8  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  26.75 
 
 		 377 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  26.44 
 
 		 377 aa  90.5  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  27.25 
 
 		 479 aa  90.1  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  25.58 
 
 		 349 aa  90.1  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  27.12 
 
 		 398 aa  89.4  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  25.12 
 
 		 501 aa  89.4  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  26.06 
 
 		 325 aa  87.8  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  26.89 
 
 		 407 aa  87.4  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  26.33 
 
 		 387 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  28.33 
 
 		 405 aa  87  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  27.32 
 
 		 396 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  26.4 
 
 		 382 aa  86.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  24.01 
 
 		 394 aa  85.9  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  29.86 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  23.12 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  27.41 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  24.43 
 
 		 376 aa  83.2  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  27 
 
 		 395 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  30.18 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  25.14 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  24.3 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 347 aa  82.8  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  23.61 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  24.52 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  27.32 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  27.32 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  27.32 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  23.6 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  23.62 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  25.7 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.74 
 
 		 399 aa  79.7  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  23.96 
 
 		 510 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  26.04 
 
 		 395 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  25.41 
 
 		 375 aa  80.1  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  24.66 
 
 		 366 aa  79.3  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1706  radical SAM domain-containing protein  23.44 
 
 		 516 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  24.94 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  24.46 
 
 		 480 aa  78.2  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  23.06 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  23.63 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  25.36 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  25.3 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  24.68 
 
 		 462 aa  76.6  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  23.88 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  24.64 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  23.8 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  25.57 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  22.64 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  24.56 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  23.4 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  26.57 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  26.02 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  25.8 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  25.37 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.31 
 
 		 397 aa  73.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 		 406 aa  73.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  23.58 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  28.61 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.08 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  32.45 
 
 		 479 aa  72.8  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  25.28 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  23.44 
 
 		 334 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  23.17 
 
 		 330 aa  72  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  25.52 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  26.49 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  24.5 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  22.8 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  23.66 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  24.47 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>