More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_18370 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_18370  predicted Fe-S oxidoreductase  100 
 
 		 384 aa  806    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2641  Radical SAM domain protein  51.03 
 
 		 358 aa  368  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.587199  normal  0.0478342 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1309  radical SAM family protein  37.32 
 
 		 357 aa  223  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  28.61 
 
 		 390 aa  136  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0890  radical SAM domain-containing protein  28.33 
 
 		 537 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0956  Radical SAM domain protein  28.36 
 
 		 532 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000891035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  29.02 
 
 		 327 aa  123  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  28.49 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  28.05 
 
 		 346 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1266  Radical SAM domain protein  27.49 
 
 		 571 aa  120  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753017 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  28.03 
 
 		 561 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  26.97 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1560  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 		 412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0307632  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  26.26 
 
 		 390 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2541  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 		 498 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  25.64 
 
 		 373 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  28.41 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  27.61 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  27.89 
 
 		 398 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 		 377 aa  110  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1210  Radical SAM domain protein  27.17 
 
 		 529 aa  110  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  28.21 
 
 		 769 aa  109  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  26.89 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  26.65 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  27.62 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  24.86 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  28.18 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 414 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.65 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  26.12 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2458  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 536 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  26.38 
 
 		 330 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  27.07 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 		 330 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  25.84 
 
 		 358 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  28.73 
 
 		 372 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 380 aa  103  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0787  Radical SAM domain protein  26.83 
 
 		 537 aa  103  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0612604  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 496 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  25.51 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  27.12 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  25.64 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  25.48 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  25.92 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  32.84 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  25.62 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  23.56 
 
 		 323 aa  100  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  26.85 
 
 		 372 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  26.16 
 
 		 391 aa  99.8  8e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 		 323 aa  99.4  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  25.41 
 
 		 377 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  24.43 
 
 		 356 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  27.7 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 333 aa  98.2  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 		 480 aa  97.8  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  25 
 
 		 410 aa  97.1  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 		 396 aa  97.1  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  23.36 
 
 		 501 aa  97.1  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  24.86 
 
 		 366 aa  96.7  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  28.41 
 
 		 396 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  25.34 
 
 		 377 aa  96.7  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  25.2 
 
 		 406 aa  96.7  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.63 
 
 		 394 aa  96.3  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  25.14 
 
 		 378 aa  95.9  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  25.14 
 
 		 377 aa  96.3  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  25.92 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  27.57 
 
 		 367 aa  95.5  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 358 aa  95.9  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  24.59 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 		 395 aa  95.9  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  24.15 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 397 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  27.17 
 
 		 394 aa  94.7  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  24.25 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 334 aa  94  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  26.82 
 
 		 332 aa  93.6  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  27.49 
 
 		 359 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  25.35 
 
 		 422 aa  94  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  25.43 
 
 		 342 aa  93.2  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  25.99 
 
 		 405 aa  92.8  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  26.72 
 
 		 349 aa  92.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 		 407 aa  92  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  26.59 
 
 		 342 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  25.07 
 
 		 479 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  24.66 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  24.86 
 
 		 399 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.4 
 
 		 399 aa  91.3  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 		 333 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  27.62 
 
 		 401 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  27.62 
 
 		 401 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  27.62 
 
 		 401 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>