189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0633 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  100 
 
 		 310 aa  621  1e-177  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  49.16 
 
 		 303 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  47 
 
 		 300 aa  265  5e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  46.67 
 
 		 300 aa  265  8e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  46.67 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  45.48 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  43 
 
 		 304 aa  244  9e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  41.14 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  45.23 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  40.38 
 
 		 300 aa  225  8e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  40.74 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  33.09 
 
 		 313 aa  166  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  38.49 
 
 		 237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  33.57 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.74 
 
 		 680 aa  149  7e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  30.53 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  34.93 
 
 		 319 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  31.79 
 
 		 320 aa  145  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  35.04 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  30.74 
 
 		 331 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  32.38 
 
 		 319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  33.09 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  36.36 
 
 		 239 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  29.64 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  31.92 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  29.93 
 
 		 328 aa  136  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  33.81 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  31.09 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.49 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  34.1 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  33.49 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  33.01 
 
 		 316 aa  122  8e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  34.56 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  33.17 
 
 		 270 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  34.42 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  28.83 
 
 		 329 aa  119  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  32.54 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  31.55 
 
 		 266 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  37.82 
 
 		 244 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  31.6 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  31.07 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  29.51 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  26.21 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  29.26 
 
 		 365 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  33.47 
 
 		 326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  29.52 
 
 		 311 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  30.66 
 
 		 320 aa  105  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  30.41 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  28.42 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  27.7 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  29.11 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  27 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  25.32 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3837  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.78 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.69 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2276  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.44 
 
 		 396 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  30.26 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2288  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.05 
 
 		 375 aa  53.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  24.15 
 
 		 358 aa  53.5  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0817  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.83 
 
 		 370 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00537332  normal  0.704127 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.69 
 
 		 372 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.512935  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2441  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.3 
 
 		 395 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0164465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7063  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.24 
 
 		 374 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00651561  normal  0.935573 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1689  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.78 
 
 		 376 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2366  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.25 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2659  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.07 
 
 		 386 aa  50.4  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00949388  normal  0.0744844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2923  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.22 
 
 		 369 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.545573 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6446  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.07 
 
 		 371 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.928018 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1061  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.54 
 
 		 369 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1581  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.88 
 
 		 341 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1976  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.95 
 
 		 337 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1926  radical SAM domain-containing protein  29.09 
 
 		 347 aa  49.7  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.265306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  27.74 
 
 		 267 aa  49.3  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.37 
 
 		 337 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1959  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.37 
 
 		 337 aa  49.3  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1937  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.37 
 
 		 337 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2133  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.37 
 
 		 337 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.34 
 
 		 344 aa  49.3  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3397  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.48 
 
 		 337 aa  49.3  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2768  molybdopterin biosynthesis, protein A  23.03 
 
 		 333 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149516  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1425  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.64 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6404  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.64 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1039  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.31 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491937  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4622  molybdenum cofactor biosynthesis protein A, N-terminus  30.83 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6965  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  23.03 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3175  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.95 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0414  radical SAM domain protein  29.84 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00760718  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4867  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.33 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4556  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.52 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1468  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.45 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  24.24 
 
 		 365 aa  47  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4475  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.83 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  25.24 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4861  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.83 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 533 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0683  Radical SAM domain protein  23.7 
 
 		 388 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0710  Radical SAM domain protein  23.7 
 
 		 388 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4457  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.83 
 
 		 339 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1109  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.03 
 
 		 370 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.038115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>