64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1531 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 308 aa  631  1e-180  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  47.21 
 
 		 312 aa  295  7e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  41.64 
 
 		 320 aa  248  7e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  40.59 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  36.07 
 
 		 319 aa  199  3e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  37.13 
 
 		 323 aa  199  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  34.31 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  39.11 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  35.74 
 
 		 311 aa  195  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  34.32 
 
 		 311 aa  195  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  37.15 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  36.77 
 
 		 312 aa  192  8e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 		 310 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  33.66 
 
 		 310 aa  188  9e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  38.83 
 
 		 323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.98 
 
 		 680 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  35.56 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  37.04 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  35.95 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  32.01 
 
 		 328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  37.24 
 
 		 330 aa  178  9e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  33.98 
 
 		 313 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  35.38 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  33.55 
 
 		 320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  34.4 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  33.79 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  33.12 
 
 		 326 aa  169  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  34.68 
 
 		 319 aa  159  7e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  32.49 
 
 		 311 aa  159  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  35.74 
 
 		 239 aa  155  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  29.3 
 
 		 332 aa  146  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  33.77 
 
 		 364 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  34.75 
 
 		 237 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  40.88 
 
 		 244 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  34.35 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  33.97 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  30.83 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  32.84 
 
 		 266 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  34.12 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  28.66 
 
 		 303 aa  122  8e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  26.63 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  31.49 
 
 		 303 aa  119  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  29.54 
 
 		 326 aa  119  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  31.6 
 
 		 300 aa  116  6e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  29.51 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  28.53 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  33.03 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  29.31 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  25.88 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 308 aa  89.7  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  24.44 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.83 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  26.88 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  25.52 
 
 		 278 aa  50.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0297  pyruvate formate-lyase activating enzyme  26.54 
 
 		 247 aa  47  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  24.64 
 
 		 267 aa  46.6  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1586  radical SAM family protein  25.49 
 
 		 356 aa  46.6  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  26.88 
 
 		 293 aa  46.2  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  23.16 
 
 		 340 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 365 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.07 
 
 		 317 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>