83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1404 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 320 aa  644    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  63.64 
 
 		 313 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  55.84 
 
 		 323 aa  348  7e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  54.87 
 
 		 323 aa  333  2e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  52.1 
 
 		 311 aa  329  4e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  50.48 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  49.67 
 
 		 319 aa  323  3e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  49.35 
 
 		 311 aa  314  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  39.93 
 
 		 320 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.55 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  36.52 
 
 		 321 aa  176  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  34.66 
 
 		 312 aa  176  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  38.75 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  37.18 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  33.55 
 
 		 308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  37.24 
 
 		 310 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  36.61 
 
 		 314 aa  172  9e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  38.03 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  36.94 
 
 		 312 aa  166  4e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  37.92 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  43.38 
 
 		 313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  40 
 
 		 313 aa  162  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  37.04 
 
 		 328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  42.92 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  33.19 
 
 		 239 aa  149  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  35.71 
 
 		 237 aa  149  8e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.39 
 
 		 680 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  31.95 
 
 		 313 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  38.32 
 
 		 319 aa  143  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  36.89 
 
 		 319 aa  142  8e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  37.29 
 
 		 326 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  37.91 
 
 		 332 aa  135  9e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  34.47 
 
 		 330 aa  133  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  36.94 
 
 		 329 aa  132  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  33.94 
 
 		 364 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  35.42 
 
 		 326 aa  129  6e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 303 aa  126  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  34.43 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  32.08 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  37.74 
 
 		 267 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  34.45 
 
 		 266 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  39.13 
 
 		 244 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  32.92 
 
 		 365 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  31.39 
 
 		 300 aa  113  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  31.86 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  31.42 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  29.86 
 
 		 304 aa  109  5e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  30.84 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  30.66 
 
 		 310 aa  105  8e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  27.71 
 
 		 302 aa  103  5e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  30.67 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  19.7 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  25.97 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  26.7 
 
 		 267 aa  50.1  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  25 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 		 372 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  26.36 
 
 		 366 aa  46.2  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1039  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.4 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  25.96 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4990  radical SAM family protein  34.68 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.396764  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  21.32 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  21.32 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 		 336 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4663  Radical SAM domain protein  29.27 
 
 		 381 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0193587 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  25.1 
 
 		 365 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0969  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.33 
 
 		 373 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.243717 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  20.25 
 
 		 369 aa  43.5  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1281  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49687  predicted protein  22.83 
 
 		 369 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.622489 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  23.46 
 
 		 332 aa  43.5  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  25.75 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2803  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.99 
 
 		 377 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000449435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2864  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.99 
 
 		 377 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1815  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.99 
 
 		 363 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184643  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2790  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.99 
 
 		 363 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00347388  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2492  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.99 
 
 		 363 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0107198  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0073  pyruvate formate lyase-activating enzyme, putative  27.62 
 
 		 365 aa  42.7  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0710  Radical SAM domain protein  31.71 
 
 		 388 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 365 aa  42.7  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0683  Radical SAM domain protein  31.71 
 
 		 388 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0519  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.99 
 
 		 360 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>