60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2377 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 365 aa  717    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  56.18 
 
 		 329 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  54.87 
 
 		 364 aa  350  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  44.48 
 
 		 332 aa  280  4e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  39.53 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  36.21 
 
 		 239 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  37.3 
 
 		 237 aa  176  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  32.75 
 
 		 319 aa  171  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  39.09 
 
 		 295 aa  169  6e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  35.5 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  35.5 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  35.59 
 
 		 319 aa  159  7e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  36.68 
 
 		 321 aa  155  7e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.25 
 
 		 680 aa  155  8e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  29.59 
 
 		 328 aa  153  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  30.54 
 
 		 313 aa  152  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  36.4 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  36.52 
 
 		 310 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  37.28 
 
 		 312 aa  146  5e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  36.32 
 
 		 312 aa  144  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  31.21 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  31.03 
 
 		 312 aa  142  9e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  35.65 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  27.65 
 
 		 326 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  40.49 
 
 		 323 aa  139  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  33.04 
 
 		 330 aa  137  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  30.83 
 
 		 308 aa  137  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  32.84 
 
 		 313 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  34.36 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  37.07 
 
 		 267 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  31.58 
 
 		 326 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  32.64 
 
 		 323 aa  129  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  31.75 
 
 		 326 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  39.34 
 
 		 244 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  29.74 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 300 aa  123  5e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  32.03 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  32.3 
 
 		 304 aa  119  7e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  31.14 
 
 		 303 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  30.52 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  32.92 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 		 303 aa  113  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  29.26 
 
 		 310 aa  112  9e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  30.67 
 
 		 266 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  29.96 
 
 		 300 aa  106  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  29.82 
 
 		 302 aa  105  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  28.63 
 
 		 300 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  30.17 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  28.63 
 
 		 300 aa  103  6e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  23.29 
 
 		 300 aa  100  5e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  22.44 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  29.37 
 
 		 278 aa  53.9  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  31.69 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2435  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.57 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.168492  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2526  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.11 
 
 		 340 aa  47  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.48 
 
 		 347 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.66 
 
 		 332 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5046  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.5 
 
 		 337 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  0.0131922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>