72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0322 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 364 aa  715    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  54.87 
 
 		 365 aa  350  2e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  51.4 
 
 		 329 aa  324  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  44.21 
 
 		 332 aa  279  5e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  40.82 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  38.39 
 
 		 239 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  45.74 
 
 		 319 aa  195  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  42.34 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  32.55 
 
 		 313 aa  186  7e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  38.91 
 
 		 319 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.11 
 
 		 680 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  29.69 
 
 		 328 aa  169  8e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  31.83 
 
 		 313 aa  169  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  40.34 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  39.92 
 
 		 295 aa  168  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  39.3 
 
 		 320 aa  166  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  40.38 
 
 		 312 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  40.67 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  37.21 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  38.5 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  37.34 
 
 		 316 aa  158  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  38.52 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.82 
 
 		 312 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  37.14 
 
 		 330 aa  153  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  32.7 
 
 		 312 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  39.61 
 
 		 311 aa  146  6e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  33.77 
 
 		 308 aa  145  9e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  31.98 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  38.74 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  45.68 
 
 		 244 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  33.01 
 
 		 311 aa  139  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 267 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  36.2 
 
 		 300 aa  136  7.000000000000001e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  38.18 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  34.17 
 
 		 326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  33.94 
 
 		 320 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  36.21 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  34.98 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  31.38 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  32.38 
 
 		 303 aa  124  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  31.9 
 
 		 304 aa  124  4e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  31.39 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  32.49 
 
 		 326 aa  122  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 266 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  31.38 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 319 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  30.96 
 
 		 300 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  27.45 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  31.6 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  31.28 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 270 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  24.06 
 
 		 231 aa  92.8  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1722  pyruvate formate-lyase activating enzyme  30.96 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461343  normal  0.162758 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  30 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1616  hypothetical protein  21.23 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.787812 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  28.24 
 
 		 291 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.72 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.48 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.209245  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  28.22 
 
 		 365 aa  47.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1498  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30 
 
 		 326 aa  47.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.286832  normal  0.0117341 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.73 
 
 		 298 aa  47  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14130  radical SAM enzyme, Cfr family  24.52 
 
 		 351 aa  47  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  33.13 
 
 		 387 aa  46.6  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2366  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.79 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0890  pyruvate formate-lyase activating  29.55 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.999298  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0169  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.61 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280654  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  26.01 
 
 		 366 aa  43.5  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  23.78 
 
 		 340 aa  43.5  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 384 aa  43.5  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.86 
 
 		 356 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0621  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.07 
 
 		 327 aa  42.7  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.239747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>